淀粉分子是由许多葡萄糖分子组成的聚合物，它是一种高分子多糖。当碘和淀粉接触时，就会发生一种称为紫色复合物的化学反应，造成淀粉的变色。此现象是由以下几点原因造成的：
1. 碘适于与淀粉分子形成氢键。碘是一种电子亲和力极强的元素，在空气中有特殊的配位法作用，能够迅速地与淀粉分子形成配位修饰。
2. 碘与淀粉分子中的α-葡萄糖单元结合后，产生一种叫做蓝色二价离子络合物的复合物。这种复合物非常的不稳定，随着时间的推移，会迅速被氧化成为无色的四价物质，则蓝色消失
3. 这个反应也不能在任何类型的淀粉中观察到，只有若干种特定类型的淀粉分子（如龙芝淀粉和马铃薯淀粉）才会产生此类荧光反应。
4. 碘溶液中的碘是一种黑褐色的液体，而淀粉是一种无色的多糖物质。而碘与淀粉分子间的相互作用会导致普通的碘在特定的条件下发生光学吸收，并产生一系列的光学散射。这种光学效应正是导致淀粉遇到碘溶液变成蓝色的主要原因。
