入职协议和劳动合同是两个不同的法律文件，但它们之间有着密切的关系。具体来说：
1. 入职协议是双方就工作岗位、薪酬待遇、试用期等事项进行的协商和约定。而劳动合同是依法成立的双方之间的权利义务关系的载体。
2. 入职协议可以在员工进入公司前签订，具有一定的灵活性和可变性。而劳动合同必须在员工正式入职后尽快签订，通常内容较为固定。
3. 入职协议只是表达双方对双方之间约定事项的意愿，并不产生法律效力。而劳动合同则是具备强制执行力的法律文件，一旦签订将对双方产生法律约束力。
综上所述，入职协议和劳动合同虽然有所区别，但是前者往往是后者的基础和先决条件，二者在保障员工权益、规范用工关系等方面都具有十分重要的作用。
