1. 养殖有区别：有机生牛乳来自于有机农场中的天然放养的食用草或牛粮喂养，而生牛乳可能来自于通过传统农业模式生产采用激素和抗生素等化学药品的动物。
2. 饮食差异：有机生牛乳的牛没有接触过人工肥料和农药，所以它们吃的都是天然的食品，这为牦牛提供了健康的基础，因此有机牛奶仅仅包含有机食品的营养成分。然而，生牛奶通常来自那些自动饲喂带有人类干预色彩的动物，这会导致食物不平衡并缺乏健康附加成分。
3. 过程管控不同：有机生牛乳在生产过程中需要经过严格的监督和管理，确保奶牛的健康以及无污染环境下生产。在这个过程中，一旦发现任何有害物质进入奶牛体内或者牛奶中，这样的奶牛及其生产的乳制品将不得不被淘汰。生牛乳则缺乏类似的质量保证。
4. 营养成分不同：有机生牛乳通常含有更多的有益脂肪和健康营养物质，例如维生素E、β-胡萝卜素、CLA、和亚麻酸等，同时也较少含有激素和抗生素等药品残留。而生牛乳则存在药品残留的风险，并且脂肪含量也可能更低。
5. 价格较贵：由于生产条件和过程的复杂性，有机生牛乳的价格通常比普通的生牛乳要高出很多。
