日语是拼音文字吗？为什么？怎么理解

不完全是。
日语的话，一个发音有对应的假名，然后假名又可以组成汉字，简单的说，拥有固定的发音和读法。打个比方。“我”在日语里是“私”，假名及对应的拼音是わ(wa)た(ta)し(shi)、那些假名都有对应的发音，不会变的，不像汉语有多音字，也不像英语th在there和thing的发音不同，很好记的。
古代日本原先就一直用的汉语（准确的说绝大部分都是汉语，大量汉字加少量假名），如日本，唐之类读音与汉字相同，二战后对日语进行改革，变成了现代日语的雏形（大量假名加少量汉字）。