1. 标本类型不同。不同类型的标本需要采用不同的染色方式。例如，血液、组织切片等需要染色，而细胞悬液则不需要染色。
2. 研究需求不同。染色可以突显出细胞或组织结构的特点，方便研究者观察和分析。然而，有些研究仅需观察标本的外形或表面特征，不需要进行染色。
3. 实验操作步骤和目的不同。染色是一种复杂的实验过程，有时需要用到有害的化学物质，如果实验目的不是为了观察某种颜色、某个细胞器或化合物的分布，则无需进行染色处理。
4. 标本保存条件不同。有些标本在染色前需要进行特殊处理，如固定、冻存等方法，否则染色效果将无法保证。而某些标本比较脆弱且不耐存放，需要尽快进行染色以避免样本损失。
5. 成本因素。进行染色需要消耗化学试剂和设备，这会增加实验成本，因此在一些条件有限的实验室中，可能会选择不进行染色处理以降低成本。
