新的《行政单位会计制度》（财库[2013]218号）相对于旧的《行政单位会计制度》（财预字[1998]49号）的变化，在《财政部国库司有关负责人就修订发布〈行政单位会计制度〉答记者问》（该文件在财政部网站的“政策发布”下面有）中有提到：
问：与原《制度》相比较，新《制度》主要有哪些方面的变化？有什么意义？
答：新《制度》通过完善会计科目和财务报表体系，详细规定会计科目使用和财务报表编制，较为全面地规范了行政单位经济业务或者事项的确认、计量、记录和报告。新《制度》既继承了原制度的合理内容，又体现了若干重大突破和创新。与原《制度》相比，新《制度》主要有十个方面变化：一是会计核算目标进一步明晰，不仅要反映行政单位预算执行情况，也要反映行政单位财务状况；二是会计核算方法进一步改进。在原《制度》仅对固定资产采用“双分录”核算方法的基础上，将该方法的应用范围扩大到所有非货币性资产和部分负债；三是更加完整地体现了财政改革对会计核算的要求；四是进一步充实了资产负债核算内容。将原制度中的资产负债科目进行细分，新增了无形资产、在建工程等会计科目；五是新增了行政单位直接负责管理的为社会提供公共服务资产的核算规定，增设“政府储备物资”、“公共基础设施”科目；六是增加固定资产折旧和无形资产摊销的会计处理；七是解决了基建会计信息未在行政单位“大账”上反映的问题，基建会计信息要定期并入行政单位会计“大账”；八是进一步完善净资产核算，增设“资产基金”和“待偿债净资产”科目；九是进一步规范单位收支会计核算；十是完善财务报表体系和结构。增加财政拨款收入支出表，改进资产负债表和收入支出表的结构和项目。
新《制度》的实施可以全面准确反映行政单位财务状况和预算执行情况，进一步提高会计信息质量，对于深化公共财政管理改革、提升行政单位财务管理水平将发挥积极作用。
