财政部在2013年分别制定颁布了新的《事业单位会计制度》和《行政单位会计制度》，对行政事业单位的会计核算进行了重大的改革。其中有关资产基金的区别如下：
一、科目名称和核算的范围不同。
1、事业单位设置3101号“非流动资产基金”科目。该科目核算事业单位长期投资、固定资产、在建工程、无形资产等非流动资产占用的金额（只对应非流动资产）。
2、行政单位设置3501号“资产基金”科目，该科目核算行政单位的预付账款、存货、固定资产、在建工程、无形资产、政府储备物资、公共基础设施等非货币性资产在净资产中占用的金额。（对应七项资产）
二、具体核算方法不同
（一）事业单位非资产基金的核算
1、在取得长期投资、固定资产、在建工程、无形资产等非流动资产或发生相关支出时确认非资产基金。借记“长期投资”、“固定资产”、“在建工程”、“无形资产”等科目，贷记本科目等有关科目；同时或待以后发生相关支出时，借记“事业支出”等有关科目，贷记“财政补助收入”、“零余额账户用款额度”、“银行存款”等科目。（双分录）
2、计提固定资产折旧、无形资产摊销时，应当冲减非流动资产基金。按照计提的折旧、摊销金额，借记非流动资产基金（固定资产、无形资产），贷记“累计折旧”、“累计摊销”科目。
3、处置长期投资、固定资产、无形资产，以及以固定资产、无形资产对外投资时，应当冲销该资产对应的非流动资产基金。
（二）、行政单位资产基金的核算
1、资产基金在发生预付账款，取得存货、固定资产、在建工程、无形资产、政府储备物资、公共基础设施时确认。（双分录）
（1）发生预付账款时，按照实际发生的金额，借记“预付账款”科目，贷记资产基金；同时，按照实际支付的金额，借记“经费支出”科目，贷记“财政拨款收入”、“零余额账户用款额度”、“银行存款”等科目。
（2）取得存货、固定资产、在建工程、无形资产、政府储备物资、公共基础设施等资产时，按照取得资产的成本，借记“存货”、“固定资产”、“在建工程”、“无形资产”、“政府储备物资”、“公共基础设施”等科目，贷记资产基金（存货、固定资产、在建工程、无形资产、政府储备物资、公共基础设施）；同时，按照实际发生的支出，借记“经费支出”科目，贷记“财政拨款收入”、“零余额账户用款额度”、“银行存款”等科目。
2、收到预付账款购买的物资或服务时，领用和发出存货、政府储备物资时，无偿调出、对外捐赠存货、政府储备物资时，均应当冲减相应的资产基金。借记资产基金，贷记有关资产科目（预付账款、存货、政府储备物资等。
3、计提固定资产折旧、公共基础设施折旧、无形资产摊销时。借记资产基金，贷记累计折旧或累计摊销
4、无偿调出、对外捐赠固定资产、无形资产、公共基础设施时，借记资产基金，借累计折旧（或累计摊销），贷记固定资产（或无形资产、公共基础设施）
三、详细核算请参看两项新制度的有关内容。
