1.会计岗位设置不符合要求。有的行政事业单位因为人员编制缺乏和领导对会计基础工作重要性认识不够等原因，不按规定设置专职会计人员，或由其他人员兼任，或使用无会计从业资格的人员。
2.会计核算不规范。会计科目设置不规范，有些科目未设置明细科目进行明细核算，如有的单位经费支出、暂存款、暂付款未设二级明细科目核算；会计科目使用不正确，如：有的单位将收入款项计入“暂存款”科目核算；会计报表、总账、明细账之间存在账表、账账不相符情况。
3.对原始凭证审核把关不严。对原始凭证的合法性没有按规定审核，有的单位报销的原始凭证没有按规定的内容填写，如发票未注明具体货物品名、规格、数量、单价、时间等，也未附相应的明细清单；报销手续不完善，存在没有经办人、证明人签字报销现象。有些工程项目无决算、无合同、无协议，仅以窗口发票报销工程款。
4.固定资产管理不完善。审计发现不少单位未建立固定资产明细账，不能如实、全面、完整地反映单位现有固定资产的价值、数量、质量及增减变化，且很多单位未严格执行固定资产定期盘存制度，实物管理与财务管理相脱节，购置固定资产不记固定资产，容易造成国有资产流失。处置、报废资产未及时从国资局办理相关手续，形成固定资产帐实不符。
5.票据管理不规范。不少单位没有建立健全票据管理办法，未建立票据领购、使用、保管、缴销登记制度，有的单位收款收据和已用完的收款收据长期存放在经办人手上，未及时到财务部门办理缴销登记手续。票据使用不合规，一些收费项目没有使用规定的行政事业性收费票据，且存在使用外购收据的现象；收据存根未妥善保管，存在遗失、不连号现象。上述票据管理不规范行为给会计核算和财务管理造成很大的漏洞。
6.现金管理不规范。一些单位在支出经济活动中应该转账支付的却以现金支付，而且很多还是大额现金支出；个别单位存在公款私存现象，货币资金长期存放于个人存折或以单位名义开立的银行定活期存单中。这种行为严重违反了现金管理的有关规定，并给单位带来了一定的风险。
