根据《个人所得税法实施条例》第三十六条第二款规定，从中国境内两处或者两处以上取得工资、薪金所得的;应当按照规定到主管税务机关办理纳税申报。
《个人所得税法》第八条规定，个人所得超过国务院规定数额的，在两处以上取得工资、薪金所得或者没有扣缴义务人的，以及具有国务院规定的其它情形的，纳税义务人应当按照国家规定办理纳税申报。
《国家税务总局关于印发〈个人所得税自行纳税申报办法(试行)〉的通知》(国税发[2006]162号)第二条规定，凡依据个人所得税法负有纳税义务的纳税人，有下列情形之一的，应当按照本办法的规定办理纳税申报：
(二)从中国境内两处或者两处以上取得工资、薪金所得的;
第十条规定，年所得12万元以上的纳税人，纳税申报地点分别为：
(二)在中国境内有两处或者两处以上任职、受雇单位的，选择并固定向其中一处单位所在地主管税务机关申报。
因此，从中国境内两处取得的工资、薪金所得，应当按照规定选择并固定在任职、受雇的一地单位所在地主管税务机关自行办理纳税申报，汇算清缴其工资、薪金收入的个人所得税，多退少补。具体计税方法，参考《国家税务总局关于印发〈征收个人所得税若干问题的规定〉的通知》(国税发〔1994〕89号)第三条关于在外商投资企业、外国企业和外国驻华机构工作的中方人员取得的工资、薪金所得的征税的问题规定：
(一)在外商投资企业、外国企业和外国驻华机构工作的中方人员取得的工资、薪金收入、凡是由雇佣单位和派遣单位分别支付的，支付单位应依照税法第八条的规定代扣代缴个人所得税。按照税法第六条第一款第一项的法规，纳税义务人应以每月全部工资、薪金收入减除法规费用后的余额为应纳税所得额。为了有利于征管，对雇佣单位和派遣单位分别支付工资、薪金的，采取由支付者中的一方减除费用的方法，即只由雇佣单位在支付工资、薪金时，按税法法规减除费用，计算扣缴个人所得税;派遣单位支付的工资、薪金不再减除费用，以支付全额直接确定适用税率，计算扣缴个人所得税。
上述纳税义务人，应持两处支付单位提供的原始明细工资、薪金单(书)和完税凭证原件，选择并固定到一地税务机关申报每月工资、薪金收入，汇算清缴其工资、薪金收入的个人所得税，多退少补。具体申报期限，由各省、自治区、直辖市税务局确定。
(二)对外商投资企业、外国企业和外国驻华机构发放给中方工作人员的工资、薪金所得，应全额征税。但对可以提供有效合同或有关凭证，能够证明其工资、薪金所得的一部分按照有关法规上交派遣(介绍)单位的，可扣除其实际上交的部分，按其余额计征个人所得税。
参考该文件的规定，任职、受雇的单位可由支付者中的一方减除费用的方法计算。
例如从A单位取得8000元(选择其为扣除费用方及所在地主管税务机关为申报汇缴机关)，从B单位取得10000元。
那么，A单位扣缴个人所得税：(8000-3500)×10%-105=345(元)。
B单位扣缴个人所得税：10000×25%-1005=1495(元)。
该个人选择到A单位所在地主管税务机关申报汇总纳税：
(8000+10000-3500)×25%-1005=2620(元)。
应补个人所得税：2620-345-1495=780(元)。
