徐福可能是第一个将中国古代文化和文明传播到日本的人。徐福到达日本的时候，日本仍处在石器时代，徐福带去的先进文化给日本社会的进步和发展带来了巨大的推动，促进了日本社会由绳纹时代向弥生时代的飞跃。
据日本考古发掘证明，早在几十万年以前，日本的土地和亚洲大陆相连。在漫长的岁月里，原始居民依靠群体的力量，使用石器和木棒等工具，以打猎和采集为生。大约距今1万多年前，日本各地发生海进，因地壳多次变动，海水上涨，日本逐渐脱离大陆，成为今天的日本列岛，由北海道、本州、四国、九州四大岛屿和数百个小岛组成。此后，日本列岛上的原始居民和世界其他地区的人类断绝了联系。
关于日本人的起源，在中国有这样一个民间传说：我国古代的秦始皇为了寻找长生不老药，派出术士徐福带领3000童男童女东渡日本，徐福一去不复返，在日本繁衍生息。徐福带去的3000童男童女经过繁衍，成为了今天的日本人。对于这个传说，中、日两国的学者一直在锲而不舍地搜集证据，进行认真的研究和探索，并希望让全世界相信徐福去日本在历史上确有其事。据史料记载，秦始皇确实曾经派徐福东渡日本寻找长生不老药，徐福在前往日本的途中遭遇风暴，船只被吹到了现在的和歌山县的新宫市。登陆之后，开始在此地劳作、繁衍。
徐福登陆的地点新宫市，是一片美丽的海岸，在海岸上还有一座红色的神社，周围平静而安宁。在新宫市附近有一个小公园，公园内有徐福的墓，是衣冠冢还是实冢就不得而知了。墓前有一块高约3米的墓碑，墓碑上用中文记载着徐福如何到达日本寻找长生不老药以及为什么定居日本的故事。墓碑立于1834年，碑上刻的“徐福之墓碑”出自高丽著名书法家之手，碑上诗歌是一位日本汉学家所写。每年的11月28日，和歌山人都会在这个公园里举行一次徐福登岸的纪念活动。
新宫的海滨随处可见大约1.5米高的断壁残垣，绵延30多公里。有日本学者认为，这是徐福模仿长城修建的一座防御工程。史料记载，在江户幕府时期，日本还曾经修复过这座长城。
在日本的很多地方，尤其是九州，都建有徐福庙。在佐贺的金立市乡村里，徐福被奉为医药神，在其他地方还被奉为水神、农耕神、蚕桑神。
徐福登陆的地区是日本文化最早的开发地区，也是日本传说中的人物神武天皇登岸的地点，因此有人认为徐福就是日本开国神话中的神武天皇。有学者根据从生活在天照大神时代重要的日本皇族墓穴中出土的一枚秦朝的铜镜和一把巨大的秦人用的战刀，推断日本皇族和徐福有很大关系，因为根据徐福登陆时期日本处于石器时代的社会现状，是不可能有这样的东西出现的。日本的弥生文化和秦汉文化几乎相同，比日本固有的绳纹文化先进了数千年，所谓的弥生文化也是徐福来到日本以后产生的。根据中国史官的记载和完备的正史资料，考证地理、日本的历史传说以及历代遗物和出土古物，证明了徐福渡海建立的王国就是日本近畿。日本神武天皇的建国和徐福同一时间、同一思想、同一制度，各个方面都符合，因此，有人断言徐福是日本历史上的第一个皇帝，神武天皇是徐福后裔在第八世纪对徐福追谥的谥号。这种说法遭到了坚信自己是神的后裔的日本学者的坚决反对。
钣野气峰是日本学者中对徐福有比较深入研究的人，他认为，徐福是齐国一位以研究长生不老药而闻名的杰出首领。徐福带来了当时中国人的知识和智慧之大成，其中包括道教。他认为，徐福是日本神道教的真正创始人。
