1、概念不一样
君主专制政体又称君主专制或君主专政，是一种政治体制和政府形式，统治者君主（常称国王或皇帝）拥有统治国家和公民自由的所有权力而没有法律或法定的程序告诉君主如何行使权力，虽然有的宗教权威可能有能力阻止君主的某些行为。
中央集权制度（centralization of authority）是一种国家政权的制度，以国家职权统一于中央政府，削弱地方政府力量为标志的政治制度。
2、所属关系不一样
君主专制必然实行中央集权，但中央集权不一定要实行君主专制。在封建社会一般实行君主专制的中央集权制度。随着社会的发展，君主专制必然被淘汰，而中央将继续存在。
3、处理形式不一样
中央集权处理的是中央和地方的关系。
君主专制制度是封建专制主义政治形态最本质的反映。
参考资料来源：百度百科-君主专制
