是的，违规，个人可以先跟单位协商让其补齐差额部分，协商不妥可以向当地劳动部门举报。
实际上应该按照实际工资作为缴费基数来计算。
用人单位应根据参保职工的上年度月平均工资，如实向地税部门申报本单位参保职工下一社保年度的社会保险缴费基数。社保缴费基数一年一定，年度内不能变更。员工缴费基数的计算口径应严格按照1990年1月1日国家统计局发布的《关于工资总额组成的规定》计算，工资总额由计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴（出差补贴、误餐补贴、独生子女补贴除外）、加班加点工资、特殊情况下支付的工资等六个部分组成。用人单位应如实申报员工上一年度的月平均工资。新参保（在本单位新参保，而不是从未参保的员工）员工，以合同约定的起薪当月的工资作为缴费基数。
