授粉前期，应根据瓜形状、颜色及植株生长势再一次去杂，同时将母本上的雄花、第一雌花和父本上的雌花全部摘除，以确保母本第2、第3朵雌花及父本花粉的质量，并备好授粉用的纸袋等工具。
授粉期每天下午扎花，选择第2天即将开放的母本的雌花和父本的雄花，全部用预先准备好的纸袋套好或用授粉夹夹住，并做好标记，第2天清晨(5：00～5：30)将父本雄花收集起来，去除花冠，按照标记逐行授粉，即将前1天套袋的母本雌蕊柱头上均匀涂抹然后套袋，并作好标记，每朵雄花一般可授2～3朵雌花。整个授粉中如发现畸形瓜应及时去掉，柱头进水的花朵应及时打掉，防止因种瓜授粉不良出现化瓜、坏瓜而影响种子产量。
授粉后管理，西葫芦授粉一般10d～15d(天)左右即可完成，授粉结束后要及时查瓜，一旦出现与标记不符合的情况和化瓜现象，要及时补救，同时对母株授粉瓜以上出现的雌花要及时摘除，摘除工作要连续坚持3d～5d(天)，确保种瓜正常发育，种瓜座住后，要严格注意防病。
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