1960年毕业于北京医学院（现北京大学医学部）并留校任教。
1970年到广州医学院进修。
1979年4月曾到英国进修。
2007年获得英国爱丁堡大学荣誉博士学位。
2010年获得澳门科技大学荣誉博士学位。
1981年8月结束进修归国。
1984年被授予首批国家级有突出贡献专家称号。
1985年后被指定为中央领导保健医生，受聘为世界卫生组织医学顾问、国际胸科协会特别会员、亚太分会理事。同年任硕士研究生导师，并获首批国家级有突出贡献的专家称号。
1993年受到广东省人民政府通令嘉奖。
1995年任博士生导师，同年被评为全国先进工作者，并荣获全国五一劳动奖章。
1990年被评为全国卫生系统优秀留学回国人员，获政府通令嘉奖，1992年获全国卫生系统模范工作者称号。
1996年5月当选为中国工程院医药与卫生工程学部院士，是中国工程院医药卫生工程学部副主任，著名呼吸内科专家。
1998年6月起任中国工程院医药卫生工程学部副主任。
2003年荣获全国五一劳动奖章，同年5月荣获“中国医学基金会华源医德风范奖”。
2005年4月13日当选中华医学会第23届会长，他是新中国成立后中华医学会七任会长中的第二位学者，此前多年，中华医学会会长一直由各任卫生部部长兼任。
1997年当选为中共十五大代表。连任第八、九届全国政协委员，2008年当选第十一届全国人大代表之一。
2003年，作为中国抗击非典型肺炎的领军人物，在SARS（中国大陆地区民间通称为“非典型肺炎”）猖獗的非常时期，钟南山不但始终在医疗最前线救死扶伤，还积极奔赴各疫区指导开展医疗工作，倡导与国际卫生组织之间的密切合作，因功勋卓著，荣获全国“五一”劳动奖章，同时被广东省荣记特等功，被广州市授予“抗非英雄”称号。
1981年回国。历任广州医学院院长，广州呼吸疾病研究所所长，呼吸内科博士生导师，中华医学会总理事，中华医学会呼吸学会副主任委员。曾受聘为国际胸科学会特别会员、国际胸科学会亚太分会理事、联合国世界卫生组织医学顾问及剑桥国际学会会员，并作为中国的唯一代表参加“全球哮喘防治方略”的制定。
工作经历
1960.07-1971.08北京医学院放射医学教研组 助教
1971.09-1974.04广州医学院第一附属医院内科 住院医师
1974.04-1978.08 广州医学院第一附属医院内科主治医师
1978.09-1982.12 广州医学院第一附属医院内科副主任医师、讲师
1979.10至今 广州呼吸疾病研究所副所长、所长
1983.01-1986.12 广州医学院副教授
1986.12至今 广州医学院教授
1986.12至今 广州医学院呼吸内科硕士导师
1987.12-1992.10 广州医学院第一附属医院院长
1992.5-2002.12 广州医学院院长、党委书记
1995.08至今 北京大学医学部呼吸内科博士生导师
1996.02-至今中国工程院院士
2007.10至今 广州呼吸疾病国家重点实验室主任
2009.7.26至今 任贵州医科大学名誉院长
