1. 过度刺激：全脑教育不断强化大脑的神经网络，导致儿童大脑容易过度兴奋，从而出现注意力不集中、失眠等问题。
2. 压力过大：全脑教育要求儿童在学习期间保持高度集中，学习任务重，要求高，容易使儿童产生压力过大，影响身心健康。
3. 短期效果：全脑教育主要注重短期记忆和技能训练，忽略了长期综合素质的培养，容易使学生产生依赖性，并且缺乏实际应用能力。
4. 超前发展：全脑教育通常会让孩子在同龄人中显示出更高水平，但是会使孩子在情感、心理、性格和社交等方面与同龄人有明显差距，影响社会适应能力等方面的发展。
5. 忽视个体差异：全脑教育追求普及性、规模性的培养方式，忽视了每一个孩子的个体差异，造成了全脑教育培养方式单一，缺乏个性化发展体系的问题。
