农业
只有12%日本土地是可耕地，为了弥补此缺点日本使用系统化耕作零碎地。使得日本有世界最高的精密农业成果也就是单位土地产量世界第一，达到粮食自给率50%只用了56000km²；（1400万英亩）农地。农业在日本是高补助与保护产业，鼓励小规模耕作，而不是美国的大规模耕作。尤其稻米是高保护产业，订定了超高490%关税阻挡外国米1988年之前还限制进口配额7.2%总消耗量以下。新规则公布后关税更提高到778%。但是小麦、黄豆之类还是和外国购买，日本也是欧盟最大的粮食出口对象。日本是世界第二大渔业国于1989年还曾创下1190万吨渔获，从1973年石油危机后，深海鱼在日本不受欢迎。浅海鱼占50%总量养殖鱼则占33%以上，最受欢迎的有沙丁鱼、金枪鱼、螃蟹、牡蛎、秋刀鱼、鲔鱼和日本鰤鱼。日本至今依然有世界最大渔船船队和全球15%的渔获量占有率。
工业
日本工业高度发达，工业结构向技术密集型和节能节材方向发展。主要部门有电子、家用电器、汽车、精密机械、造船、钢铁、化工和医药等，工业产品在国际市场上具有很强的竞争力。主要工业区大都集中在太平洋沿岸。
日本工业集中于几个工业区的方式发展，例如关东地方和东海地方，东京和福冈之间。
一个狭长型的工业地带拥有亚洲最悠久的工业史。许多产业在日本是高度发展，包含消费性电子、汽车、半导体、光纤、光电、多媒体、影印机、高级食品。但是也有一些产业日本并不重视或是没有发展条件例如卫星、火箭、大型飞机。因为这些需要大量矿产基础也具有军事敏感性，所以日本宇宙航空研究开发机构也许会采用和别国合作方式完成载人登月行动，因为这些行业的配套行业例如电脑补助生产（CAD、CAM），软件数据库，日本都已经具备。总体而言“日本制造”的高品质深植人心。
矿业
因为日本属于火山活动多发地域，所以埋藏的矿物资源种类丰富。因此在第二次世界大战之前，矿业比较发达。但到了战后，对矿业危害的环境对策，以及从业人员的安全对策造成生产成本大幅增加，导致了行业衰退。仍在出产的有：成本较低的可以露天挖掘的石英、石灰石，以及纯度高，有国际竞争力的金、银、石油、天然气等。
科技
日本的科学研发能力位居世界第二，应用科学、机械、及医学等领域尤为突出。每年的科研经费达1300亿美元，高居全球第二。日本在电子、手机通讯、低耗能环保车、机械、工业机器人、光学、化学、半导体和金属等多项领域具世界领先技术且屡获殊荣。日本的工业用机器人产量占世界一半以上。
服务业
日本服务业产值极为重要占了全国3/4的经济产值。银行、保险、房产中介、零售（百货）、客运、通讯都算是服务业。像是三菱UFJ、Mizuho、NTT、TEPCO、Nomura、三菱地产、新东京海上产物、JR铁路。全日空等公司都是全球中该领域的龙头地位。将来日本邮政改革后将在2014成为全国最大保险公司。日本有326家企业名列全球福布斯2000大排名占16.3%（2006年）。在可见的未来服务业将是日本最大规模产业也是工作机会提供者。
根据日本经济产业省公布的一组相关数据，2003年4月至2004年3月，日本的动漫市场销售额（动漫电影票房、动漫电影以及动漫电视录像带、电视专门频道等的营业收入总额）达3739亿日元，比2002年度的2135亿日元增长了1604亿日元，增幅高达75.1%以上。另根据日本出版科学研究所统计资料，在日本所有的出版物中，漫画读物约占出版物总数的40%。2003年日本共销售图书杂志22278亿日元。
通过以上相关数据根据日元美元相关汇率计算，2003年日本动漫产业总值约为149亿美元（由于日元美元汇率变化较大，取为中间值120）。占其当年GDP的0.3%，由于动漫产业链较长，若计算其他相关衍生产品，已经成为了日本的第二大盈利性支柱产业。据日本一家网络媒体介绍，实际上广义（其中包括玩具制造业、饮食业、旅游业、电子制造业，甚至汽车业和农业）上的日本动漫产业已经占日本GDP十几个百分点。
外贸
外贸在国民经济中占重要地位。日本从20世纪50年代开始确立了贸易立国的发展方针。“入关”后，日本开始取得和其他缔约方同样的平等地位。按照关贸总协定中的最惠国待遇的基本原则，同大多数国家和地区进行自由贸易，为日本对外贸易规模的不断扩大创造了有利的国际市场条件。此后，日本对外贸易迅速增长，主要贸易对象为美国、亚洲国家和欧盟国家。日本财政年度从当年4月1日至次年3月31日。
主要进口商品有：原油、天然气等一次能源、食品、原材料等；主要出口商品有：汽车、电器、一般机械、化学制品等。主要贸易对象是中国大陆、美国、东盟、韩国、中国台湾、中国香港、德国等。日本对华出口减少，是造成贸易逆差的主要原因之一。
2012年9月份，日本对华出口同比减少14.1%。从口红到汽车，众多日本品牌无一幸免。其中，日本汽车对华出口同比减少44.5%，汽车零部件也下降了17.5%。中日贸易对中日局势的反应最为敏感，最新的贸易数据更是进一步揭示了领土争端对日本经济的影响，两国关系恶化将会重创日本经济。但日本《朝日新闻》刊发评论文章却认为，日本对华出口减少将会影响中国的就业，同时，在华企业员工的实际收入也会减少。
2014年，日本海外净资产增加13%，达到366.9万亿日元（约合3万亿美元）。至此，日本已经连续24年为全球最大债权国。
