日本籍与日本永久居留证（日本绿卡）主要有政治权利，出入境，教育收费方面的区别：
1、政治权利的不同，日本籍在日本参政权包括选举权和被选举权，可以加入某一个你喜欢的政党，还可以竞选议员。永住权也仅仅只是在日本居住的权利，没有资格投票参加选举，从政自然也是不可能的。
2、出入境限制的不同，中国对日本护照免签，但是该期限也只有15天，如果因为工作或者其他原因需要在中国常驻，那就需要申请签证了。拿到日本的永久居住权的你依然还是中国公民，任何时候都可以回中国。
3、教育收费的不同，日本籍子女在日本读大学，无法再享受日本各大学针对外国人的奖学金制度，以及大学学费减免等政策。拿到日本永久居留证（日本绿卡），子女依然可以享受日本大学对外国留学生的种种优惠政策。
参考资料来源：百度百科-绿卡 （外籍人口永久居住许可证）
参考资料来源：百度百科-日籍华人
