1、中国酱油里大多加麸皮，而日本寿司酱油加小麦
中国酱油：豆渣+麸皮：中国酱油传统做法用的是豆渣加小麦。但在20世纪50年代，为了节约成本，开始大量使用小麦麸皮进行代替。这样做产量是增加了，但酱油色泽变淡，风味也变得单薄了。
日本寿司酱油：豆渣+小麦：日本酱油的做法是从中国传入，所以也遵循了豆渣加小麦的配方，至今仍然如此。小麦经过焙炒会散发香气，为酱油增添风味，变得浓郁。曾经有段时间，日本物资紧缺，于是也用麸皮代替了小麦来酿酱油，但不久就又用回了小麦。
2、中国采用低盐固态发酵，日本寿司酱油采用高盐稀态发酵
中国：低盐固态发酵：加的盐水浓度低且量小，制成酱醅固态发酵，制作周期短，一个月内就可以完成。中国传统酱油制作讲究「春曲夏酱秋油」，一缸酱需要经历至少半年时间的发酵，才可以抽出第一道酱油。但是现在的做法大大缩短了时间，各种微生物不能丰富生长，味道自然也大打折扣。
日本：高盐稀态发酵：加的盐水浓度高而且量大，制成酱醪稀态发酵。这样制成的酱油风味浓郁香醇，品质很好。日本如今的酱油生产，大都会对细节进行精准控制，制作周期长，保证出品优质且稳定。
3、中国酱油分为老抽和生抽，日本寿司酱油分为浓口、薄口、白、溜、再仕込
中国：生抽和老抽
一缸酱发酵好后，抽出酱油，这是头抽；加入盐水，发酵几天抽出来，是二抽；然后再加盐水，发酵几天抽出来，是三抽。老抽是在生抽基础上加了焦糖，所以颜色更深，更适合给食物上色。
日本：浓、薄、白、溜、再仕込
浓口酱油：在日本说的酱油通常是浓口酱油。
薄口酱油：颜色比浓口浅，咸度比浓口高。
白酱油：颜色清澈，糖分较高 。
溜溜酱油：制作味噌时分离出来的汁，颜色较浓 。
再仕込酱油：向酿好的生酱油内加入米曲后进行二次酿造，色、香、味都比浓口酱油更为浓厚。
4、中国酿造酱油允许放添加剂，日本寿司酱油通常不放
不仅是两国的分级标准不同，中国的酿造酱油还允许放添加剂来增加鲜味，但是日本的本酿造酱油通常不放添加剂，完全靠自身来提鲜。
