申请微型企业的主要好处是国家对微型企业有税收政策优惠。
中国相继出台了一系列促进小型微型企业发展的税收政策，为小型微型企业“减负”，鼓励并支持其发展。
一、2009年1月1日起，中国开始施行新的《增值税暂行条例》，条例中将小规模纳税人的征收率从6%和4%统一降至3%，显著降低了小型微型企业的税负。
二、2010年1月1日起，中国还对年应纳税所得额低于3万元（含3万元）的小型微利企业，所得减按50%计入应纳税所得额，按20%的税率缴纳企业所得税。
三、金融机构向小型微型企业贷款合同三年内免征印花税
