截至2015年5月，该所共有在职职工539人。包括研究员及正高级工程技术人员66人、副研究员及高级工程技术人员110人。科研人员中，有中国科学院院士2人，国家杰出青年科学基金获得者8人，国家优秀青年科学基金获得者2人，“百千万人才工程”国家级人选7人，享受国务院颁发政府特殊津贴人员15人，中青年科技创新领军人才2人，“外专千人计划”入选者1人，“青年千人计划”入选者4人，中科院“百人计划”入选者26人，云南省科技创新领军人才1人，云南省高端科技人才引进计划入选者12人，有“创新团队国际合作伙伴”1个，云南省创新团队3个。
中国科学院院士：周俊、孙汉董
国家杰出青年：郝小江、李德铢、刘吉开、杨祝良、孙航、谭宁华、陈纪军
国家百千万人才工程：郝小江、刘吉开、陈纪军、邱明华、李德铢、孙航、高立志
青年千人计划：胡凯锋、吴建强、黄胜雄 中国科学院“百人计划”入选者：刘吉开郝小江李德铢朱华结杨祝良李唯奇高立志孙航谭宁华罗怀容李艳郭振华胡向阳夏成峰黎胜红杨玉荣熊文勇秦红波吴滨赵金华刘爱忠刘莉章成君 截至2015年5月，该所研究系统设置“三室一库”，即1个国家重点实验室、1个中国科学院重点实验室、1个所级重点实验设施、1个种质资源库；此外，还有1个植物园、2个联合共建中心。
国家重点实验室：植物化学与西部植物资源持续利用国家重点实验室
中国科学院重点实验室：中国科学院东亚植物多样性与生物地理学重点实验室
所级重点实验室：资源植物与生物技术重点实验室
种质资源库：中国西南野生生物种质资源库
植物园：昆明植物园
共建中心：山地生态系统研究中心（世界农用林业中心）、海盐工程技术中心（浙江省海盐县） 院地合作 2015年1月28日，中国文化大学景观系主任潘富俊教授等一行18人访问中国科学院昆明植物研究所。
2015年1月31日，秦岭国家植物园园长彭鸿一行3人访问了中国科学院昆明植物研究所。
2014年11月15日至19日，第十届中国昆明泛亚国际农业博览会在昆明会展中心举办。
此外，研究所是云南省植物学会和中国植物学会民族植物学分会的挂靠单位，其中云南省植物学会通过了云南省学术性社会团体的等级评估，获得了4A级学会称号。 国际合作 2015年8月31日，昆明植物所与新西兰植物与食品研究院签署合作备忘录。
2015年8月10日，美国加利福尼亚州立大学戴维斯分校Steven Theg教授访问昆明植物所。
2014年10月24日，英国皇家园艺协会代表团访问昆明植物所。
2014年8月27日，国际水稻研究所Kenneth McNally博士和Michael Thomson博士访问昆明植物所。
