单行本册数
话数
标题
对应动画
Vol.1 File.1（总File.1）
现代的福尔摩斯
TV1 云霄飞车杀人事件
Vol.2 File.7（总File.16）
恶魔般的主使者
TV128 黑衣组织10亿日元抢劫事件
（仅最后部分与漫画对应）
Vol.4 File.4（总File.33）
黑色公事包之谜
TV5将这Gin和Vodka换成他人，故无对应
File.5（总File.34）
特色车厢上的4个人
File.6（总File.35）
倒数10秒钟
Vol.19 File.1（总File.181）
为什么？
TV 129来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件
Vol.24 File.7（总File.238）
背叛的街角
TV176~178 与黑衣组织的再会
File.8（总File.239）
漆黑的丧葬行列
File.9（总File.240）
不告而别
File.10（总File.241）
来自过去的子弹
File.11（总File.242）
白色世界
Vol.29 File.3（总File.287）
看不见的恐怖
TV230 神秘的乘客（前篇）
Vol.38 File.1（总File.383）
新式武器！
TV311 与黑衣组织的接触（决死篇）
Vol..42 File.5（总File.429）
满月之夜和黑色宴会陷阱
TV345 与黑衣组织直面对决 满月之夜的双重迷案
File.10（总File.434）
腐烂的苹果
Vol.48
File.9（总File.499）
恐怖的敲门声
TV425 黑色冲击！被组织的魔爪触碰的瞬间
File.10（总File.500）
新黑衣成员
Vol.49
File.1（总File.501）
追踪目标！
File.2（总File.502）
新的指令
File.3（总File.503）
黑衣组织 VS FBI ①
File.4（总File.504）
黑衣组织 VS FBI ②
Vol.53 File.10（总File.553）
不可思议的打工
TV464 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬
Vol.54 File.2（总File.555）
做梦的星星
TV465 黑衣组织的影子 珍珠的流星
Vol.58 File.2（总File.599）
赤井的过去
TV497 红与黑的碰撞 觉醒
File.5（总File.602）
最终手段
TV499 红与黑的碰撞 伪装
File.6（总File.603）
任务
File.8（总File.605）
意外的嫌疑人
TV500 红与黑的碰撞 遗言
File.9（总File.606）
黑色星期五
TV501 红与黑的碰撞 嫌疑
File.10（总File.607）
卡迈尔的过去
TV502 红与黑的碰撞 洁白
File.11（总File.608）
魔法的咒语
TV504 红与黑的碰撞 殉职
Vol.59
File.1（总File.609）
钢楔
Vol.67 File.4（总File.700）
危险的区域
TV579 黑与13的暗示
File.5（总File.701）
红色和13的暗示
File.6（总File.702）
炸弹犯的目的
TV580 逼近的黑色时刻
File.7（总File.703）
暴风雪中的真相
File.8（总File.704）
安静的战争
TV581 摇曳的红色目标
Vol.78 File.1（总File.818）
神秘列车（启程）
TV701 漆黑的特快列车（发车）
File.3（总File.820）
神秘列车（一等）
TV702 漆黑的特快列车（隧道）
File.7（总File.824）
神秘列车（终点）
TV704 漆黑的特快列车（终点）
未收入单行本 File.953 宛如暗鬼不明真身 -
