阿里巴巴早期的投资者包括由高盛、TranspacCapital、InvestorABofSweden、technologyDevelopmentFundeofSingapore组成的风险投资团，1999年10月，该财团联合向阿里巴巴投入500万美元。除此之外，阿里巴巴最大的投资者为日本软银，2000年和2004年软银先后注资阿里巴巴2000万美元与6200万美元。
阿里巴巴此前三轮私募完成后，创业团队占47%的股份，富达约占18%，其他几家股东合计约15%，软银约占20%。
在雅虎和阿里巴巴合作之后，雅虎将拥有40%的股权。如果不考虑一些机构投资者的退出，创业团队股权将被稀释到28.2%，富达稀释至12.8%，其他几家股东稀释至9%，软银稀释至12%。加上增持阿里巴巴股份，软银将持股阿里巴巴16%，成为雅虎与创业团队之外的第三大股东。
在雅巴交易完成后，马云及其公司管理层手中的股票比例可将为28.2%，从而将第一大股东的位置让给了新加入的雅虎。但是如何保证其控股地位和对企业的实际控制权？是一个值得研究的问题。分析阿里巴巴的发展和马云的强势性格，绝对不会把阿里巴巴的控制权让给他人。在机制上如何实现呢？我们可从雅虎提交给SEC的8-K文件看出，雅虎将持有阿里巴巴201617750股普通股，约占阿里巴巴整体股份的40%，35%的投票权。雅虎为此付出的代价是10美元、雅虎中国的所有业务、雅虎品牌及技术在中国的使用权。
