香港澳门居住证和往来内地通行证的区别：
一、制发的依据不同
港澳居民居住证发放的依据是刚才侍部长已经发布的，即将实施的《港澳台居民证据证申领发放办法》。
往来内地通行证发放的依据是中国公民因私往来香港、澳门的管理办法。
二、功能定位不同
港澳居民的居住证主要是为符合法定条件的港澳居民在内地居住提供身份证明，并享有相关的权利、基本的公共服务和便利而制发的。
往来内地通行证作为一种旅行证件，主要是为了港澳居民中的中国公民来往内地提供一个身份的凭证。
三、外观不同
港澳居民的居住证正面印有台湾居民居住证。
往来内地通行证正面印有港澳居民来往内地通行证。
扩展资料：
在“一国两制”的情况下，内地和港澳实行不同的社会制度和出入境管理制度，港澳居民在港澳和内地须持不同的身份证件和旅行证件，其中港澳居民在内地的身份证和出入内地的证件由内地来作出规定。
实施港澳居民居住证制度，是为港澳居民在内地学习、创业、就业、生活提供便利，支持香港、澳门融入国家发展大局的重要举措。
《港澳台居民居住证申领发放办法》 第3条 规定
港澳居民居住证登载的信息有一项叫做公民的身份号码，香港、澳门居民公民身份号码地址码分别使用810000、820000，这是内地首次在法律上明确港澳居民编制公民身份号码，而且是按照国家标准来编制，与内地其他的省、自治区、直辖市统一编制。
参考资料来源：人民网-《港澳台居民居住证申领发放办法》将公布
参考资料来源：人民网-公安部详解新版港澳居民来往内地通行证
