结果以后的设施桃树，通过对树形的改造与培养，一般成为二主枝开心形或三主枝开心形。但由于设施桃树栽植密度较大，树冠比露地栽培的小，各主枝上一般不配备侧枝，在主枝上直接着生结果枝组。
（1）主枝的修剪
为了防止树冠下部光秃，增加有效结果面积，各主枝一般要保持45°～50°的开张角度。主枝延长枝的修剪一般采用长放或轻短截的方法，通过轻短截或长放，可以使延长枝大量结果，增加产量；另外，由于延长枝大量结果，可有效地控制延长枝的生长，延缓延长枝的生长速度，以适应设施桃树栽植密度较大的特点。
（2）结果枝组的修剪
结果枝组是由两个以上结果枝组成、直接着生在各主枝上的结果枝群。结果枝组按其占有空间大小、分枝多少分为：大型结果枝组、中型结果枝组和小型结果枝组。大型结果枝组占有空间大，生长势强，结果稳定，寿命长；小型结果枝组占有空间小，生长势弱，不易更新，寿命短；中型结果枝组居于两者之间。整形修剪时，应有计划地培养、配置各类结果枝组，使大、中、小型结果枝组相互配合，充分利用空间，做到立体结果。
在密植情况下，设施桃树的结果枝组以中、小型为主。各枝组之间必须保持一定的间距，同方向的大型结果枝组之间要保持50～70厘米距离，中型结果枝组保持30～50厘米的间距，在大、中型结果枝组之间插空安排小型结果枝组。总之，要保证透光，生长均衡，主从分明，高低参差，排列紧凑，不挤不秃的原则。
结果枝组修剪的目的，是在主枝上配置好各类结果枝组、维持枝组的生长势、防止树冠下部光秃。设施桃树结果枝组的修剪是通过采后修剪与冬季修剪来完成的。冬季修剪时要根据枝组的生长势，即结果能力来确定修剪的程度。对于生长势强、生长空间大、枝组上的分枝均为良好的结果枝的，不进行回缩修剪，可利用强壮结果枝结果；对于生长势弱、枝组上的分枝均为短果枝或花束状果枝的要进行回缩，以增强枝组的生长势。在枝组密度较大的情况下，要适当疏间过密的枝组，以保证生长季树冠下良好的受光量。
（3）结果枝的修剪
结果枝的修剪原则仍是“因势修剪，强者长留，弱者短留”。在具体修剪时，首先安排好果枝的密度，果枝的距离，一般是从剪口处算，相邻果枝间距20厘米左右为宜。延伸方向要互相错开。其次根据不同果枝的长势及结果能力进行适当的短截。一般弱果枝，在确保下部有叶芽的基础上，可剪留枝长的1/3～1/2；中庸果枝剪留1/2～2/3；强壮果枝剪留2/3或轻打头（甚至长放）。
