应交税金为负数主要是：应付款负数在出资产负债表时可以进行重新分类，负数可以作为预付账款，如果没有预付几款，也可以作为应收账款。以前年度多交所致；进项税大于销项税；出口实行先征后退的税收政策,期末应交税金为负数为公司应退回的税额。
查清是什么原因，多数可能是上缴税款，没有计提，只要补提就可以了，若是有进项税在里面，把他转到成本里，和他解释，以前会计没有计提，只是交了走在借方导致的。资产负债表应交税金项目偶尔出现负数是可以的，但长期这样就不行的了。你每月有交税，就可以按交税额提前计提销项税来冲平。
应交税金出现负数，主要是【未交税金】正常情况下，在提取的时候所反映的余额，应该是贷方余额【未交税金】期末数是负数，说明在交纳税金的时候多于你提取的数，也就是说交多了，不是什么大问题，下个月再进行调整就可以了，主要是采用核定应税所得率征收所得税的纳税人在申报所得税时，因此只要销售收入录入准确，申报应征税金出现负数，是启用新系统后计算方法变化所致，纳税人不必自已进行处理，视同正常情况申报，申报的应征税金负数在以后月份申报的所得税中进行抵缴，抵完为止。如果是确定帐没错，一般是由于应交增值税进项税余额大于销项税余额所造成的，也就是增值税纳税申报表上的【留抵税】。
另外，由于所得税是按季预缴，年度清算的方式纳税，所以也不排除多交的所得税款，所提的第一点不成立的话，可能就是没有计提当月的销项税。
