（1）初审。向科技或经贸部门提交初审材料，审核是否属于研究开发项目。 每年12月31日前报送本年度研究开发项目初审材料，未通过初审的研究开发项目，不得享受。
（2）鉴证。通过初审的研究开发项目，其年度研究开发费用的真实性、合法性与公允性须经有资质的中介机构进行鉴证，并出具年度研究开发费用鉴证报告。
（3）向主管税务机关申请年度研究开发费的加计扣除。企业应在年度纳税申报期内（每年5月31日前）向税务机关提交以下材料：①通过初审的企业研究开发项目审查表（附件1）；②企业研究开发项目实际发生费用年度汇总表（附件3）；③经有资质的中介机构出具的年度研究开发费用鉴证报告。
