1、住房公积金个人住房贷款的最低首付不同：
具体首付比例如下：
2、住房公积金个人住房贷款的最高可贷款额度不同：
具体最高可贷款额度如下：
3、贷款额度与最高可抵押价值的关系不同：
购买二手住房申请住房公积金个人住房贷款的，贷款额度不能超过二手房评估机构评估出的该套二手住房最高可抵押价值。
4、担保方式不同
首套房申请住房公积金个人住房贷款常见的担保方式主要有：抵押担保、抵押加开发商阶段性连带责任保证担保、抵押加北京市住房贷款担保中心阶段性连带责任保证担保等。
购买二手住房申请住房公积金个人住房贷款的，应采用抵押担保方式，完成所购住房抵押登记后发放贷款。
5、是否需要办理住房评估的要求不同：
只有购买二手住房并申请住房公积金个人住房贷款需要办理住房评估，借款申请人可在北京住房公积金管理中心公布的从事二手房评估业务的机构名单中选择任意评估机构办理住房评估。
参考资料来源：北京住房公积金网-住房公积金个人住房贷款业务问答
