专项应付款科目是核算企业取得政府作为企业所有者投入的具有专项或特定用途的款项。本科目可按资本性投资项目进行明细核算。
企业收到专项拨款时，借：“银行存款”，贷：“专项应付款”;将专项或特定用途的拨款用于工程项目，借记“在建工程”等科目，贷记“银行存款”、“应付职工薪酬”等科目。
工程项目完工形成长期资产的部分，借记“专项应付款”，贷记“资本公积---资本溢价”科目;对未形成长期资产需要核销的部份，借记“专项应付款”，贷记“在建工程”等科目;拨款结余需要返还的，借记“专项应付款”科目，贷记“银行存款”科目。
