中国自然保护区的功能区分为以下三个：
1. 核心保护区：即“禁止人类干预”的区域，是自然保护区中最受保护程度最高的区域。它是指生态系统最为脆弱，物种数量和生态系统功效最为突出的核心区域，一般面积很小，一般情况下面积不超过保护区总面积的10%。
2. 缓冲区：位于核心保护区和利用区之间，承担着缓冲道路破坏生态系统的阻隔功能。在缓冲区内限制人类活动，但经济活动和生态旅游活动可作为可接受的活动，以吸引特定的人群到达该地区开展旅游，从而实现以自然保护为目的的运作方式，在这个区域内限制了土地开发和基础设施建设等活动。
3. 利用区：也称为“开发区”，是保护区生态环境维持的主要来源，允许有限的人类活动，促进自然资源的合理利用。为确保此区域的永久保护，利用活动要以实现生态、社会、经济统筹发展为原则，有时为了促进经济发展会以部分环境破坏作为代价。
