联盟国的官方旗帜，实际上被称为“星条旗”（Stars and Bars）者，上有七星，代表最初建国的七州。因为这面旗帜在战斗中有时与联邦旗帜难以区分，所以在军事行动中较常使用者为联盟国的军旗，即被称为“南方十字旗”者。南方十字旗上有十三颗星，加入了在萨姆特堡之战后参与的四州，以及支持联邦的政府与分离份子较劲的肯塔基与密苏里两州（参见密苏里脱离联邦）。经20世纪大众传媒报道后，“南方十字旗”在成为今日与联盟国密切相关的表征。南方十字旗是正方形旗帜，常见的长方形南方十字旗其实是田纳西第一军团（First Tennessee Army）的旗帜；因其最初用于联盟国海军，故又称为“舰艏旗”（Naval Jack）。
在舰艏旗采用后，“联盟国”便将南方十字旗外围加上白边（第二幅图），成为无暇旗。后又因与投降的白旗过于相似，便在右边加上了红条（第三幅图），称之为鲜血无暇旗。
