可以在异地补办港澳通行证。
港澳通行证丢失分为两种情况：一是在大陆地区丢失港澳通行证，二是在港澳地区丢失港澳通行证。
如果是在大陆地区丢失港澳通行证的话，只要拿着身份证原件，前往当地的出入境管理部门挂失，并且提交补办申请，按程序补办新的港澳通行证。
如果是在港澳地区丢失港澳通行证的话，需要先前往外交部驻港公署提交挂失申请。申请提交审核成功之后，我们还需要前往香港出入境管理处，补办港澳通行证，填写相关材料，领取新的港澳通行证。
扩展资料：
2018年9月1日起，内地居民可在全国范围内任一公安出入境管理机构异地申请换（补）发普通护照、往来港澳通行证、往来台湾通行证；可在全国范围内任一公安出入境管理机构异地申请往来港澳台团队旅游签注。
2019年4月1日起，中华人民共和国往来港澳通行证，实行“全国通办”。申请人异地申办赴港澳台团队旅游签注，还可在自助签注机上办理，立等可取。
参考资料来源：人民网_异地办理出入境证件，更简单了
