港澳通行证丢失后是可以在异地补办的，需要申请人去市公安局出入境管理管理部门重新提出申请。
一、书面文件：
1、打印并填写完整的《内地居民往来港澳申请表》1份，附上申请人近期正面免冠蓝底光面彩色照片（相片大小：48×33mm，头部长度：28-33 mm，头部宽度：21-24 mm）3张；
⒉、申请人的二代居民身份证、户口簿或其他户籍证明的复印件，同时原件要交予核验；
3、补办港澳通行证的申请人，需提供书面的遗失证明或声明文件，并写上：“因遗失往来港澳通行证引起的所有纠纷由本人自己承担”等说明。
4、现金，初次办理是100元，补办80元。
二、办理地点：所在地公安机关出入境管理部门
三、办理时间：大约是两周左右领取，必须本人亲自办理。
办理完成后可以自行去办理处领取，也可以在办理的时候选择邮寄到申请人所在地，邮费自理。
四、港澳通行证有效期：
港澳通行证有效期5年，签注类别有探亲签注、商务签注、团队旅游签注、个人旅游签注、其他签注和逗留签注。
扩展资料：
2018年08月28日，公安部在北京召开新闻发布会，国家移民管理局通报将于9月1日起施行“内地居民可在全国范围内异地申请换（补）发出入境证件”“申办出入境证件7个工作日内办结”等5项便利措施。
内地居民可在全国范围内异地申请换（补）发出入境证件。申请人可在全国范围内任一公安出入境管理机构异地申请换（补）发普通护照、往来港澳通行证、往来台湾通行证，申办手续与户籍地一致。
参考资料来源：
