1.赔偿范围不同。
医疗事故损害赔偿包括：医疗费、误工费、陪护费、住院伙食补助费、残疾生活补助费、残疾用具费、丧葬费、被扶养人生活费、交通费、住宿费、精神损害抚慰金等11项，而一般医疗人身损害赔偿比其多了一项死亡赔偿金。
2.适用法律不同。
目前医疗损害都是以医疗损害责任纠纷为案由起诉的，只不过在审理中，属于医疗事故的按照《医疗事故处理条例》审理，不符合医疗事故的按照《民法通则》、《最高人民法院关于审理人身损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》处理。
3.赔偿计算标准不同。
医疗事故损害的赔偿较低，以精神损害抚慰金为例：
《医疗事故处理条例》规定的精神损害抚慰金按照医疗事故发生地居民年平均生活费计算，“造成患者死亡的，赔偿年限最长不超过6年;造成患者残疾的，赔偿年限最长不超过3年”。
《人身损害赔偿司法解释》第十八条规定按照《最高人民法院关于确定民事侵权精神损害赔偿责任若干问题的解释》确定精神损害抚慰金的数额，精神损害的赔偿数额根据以下因素确定：
(一)侵权人的过错程度，法律另有规定的除外;
(二)侵害的手段、场合、行为方式等具体情节;
(三)侵权行为所造成的后果;
(四)侵权人的获利情况;
(五)侵权人承担责任的经济能力;
(六)受诉法院所在地平均生活水平。
