抗菌药物临床应用应当遵循以下原则：
1、病毒感染，如感冒、流感等不宜使用抗生素。
2、发热待查（除非病情严重，临床经验高度怀疑细菌感染者）不宜使用抗生素。
3、皮肤及粘膜等局部应尽量避免使用抗生素，以免引起耐药菌产生或变态反应。
4、青霉素（G）：是第一个发现的抗生素，肺炎球菌、A组溶血性链球菌及脆弱类杆菌的厌氧菌感染等仍属首选药物。
5、大环内酯类：宜用于轻度、中度呼吸道感染、支原体及衣原体感染。
6、氨基糖甙类：每日一次加10%葡萄糖液100ml，静滴疗效好，毒性小、不易产生耐药菌株，宜用于G-杆菌感染、金黄色葡萄球菌感染等，疗程约7天。要注意其能引起耳、肾毒性。7、喹诺酮类：多适用于尿路感染、肠道感染及轻度、中度呼吸道感染。
8、头孢菌素：除第一代、某些第二代及口服制剂外，一般属于非首选药物。如属于中度及重度医院内感染可用第三代头孢菌素，属于医院内重症感染、重症混合感染（需氧菌及厌氧菌）、免疫功能低下病人可考虑用泰能。
9、最好按细菌药敏试验结果选药。要熟悉选用药物的抗菌活性、药效学及药动学。
10、当一种抗菌药物能控制感染时，尽可能不采取联用，减少不必要的使用抗菌药物。
11、单一抗菌药物无效时或重度感染病人，可按药敏试验选用两种抗菌药物联用，一般不联用三种以上的抗菌药物。
12、静滴抗生素比口服抗生素贵，如病情许可应口服抗生素。
13、严重感染的病人初期需要静滴抗生素，待病情稳定后可改用相同口服抗生素。
14、重症感染者如用头孢他定及泰能可考虑经验治疗。在某些临床情况下也可考虑次强广谱抗生素如头孢哌酮，这样可延长前者的抗菌性。
15、要严格掌握万古霉素适应症，①由耐β—内酰胺抗生素的G+球菌引起的严重感染。②G+球菌感染病人对β—内酰胺抗生素严重过敏；③抗生素相关肠炎患者，用甲硝唑治疗无效，或病情十分严重，并有危及生命的可能等再用该抗生素。
16、如遇两种抗生素对同一种细菌敏感时，则选其中便宜的。
17、一般急性感染。抗生素在体温恢复正常，症状消失后继续用2~3天。急性感染病程不易迁延者（如急性肠炎），病情基本控制后1~3即可停药。G+球菌肺炎；退热后3~5天，金葡菌肺炎疗程需要稍长可停药。G-杆菌肺炎；退热后5~7天可停药。尿路感染；疗程3~5天，反复发作者稍延长。败血症；病情好转，体温正常7~10天后再停药。
18、急性感染，应用抗生素后临床疗效不显著，一般在72小时应考虑改用其他抗菌药物。19、外科预防性用药：一般而言可在手术前30分钟预防性给药。
20、对新药、高档药的商品名、化学名与现有的抗生素对照，是否原有的抗生素改变了商品名。必须熟悉新药、高档药的抗菌谱、适应症、不良反应、配伍禁忌等。
21、抗生素配伍要合理：两种抗生素同时应用，尤其要考虑有无理化、药理等配伍禁忌。
