（一）自然环境中，细菌、病毒等微生物无处不在，但绝大多数微生物对人体都是无害的，有的还有益处。在日常生活中，人们经常接触到的微生物主要是人体体表和空气中的微生物。
空气中的微生物，主要有附着于尘埃上从地面飞起的球菌属（包括八叠球菌属在内的好氧菌）、形成孢子的好氧性杆菌（如枯草芽孢杆菌）、色串孢属等野生酵母、青霉等霉菌的孢子等。
人体皮肤表层存在着一定量的微生物群，通常包括三类：①常住菌群，如痤疮丙酸杆菌等菌群，它们是保护人体免受有害微生物侵袭的屏障。②过路菌群，如金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等细菌及真菌菌群，这些菌群往往是致病菌。③共生菌群，如表皮葡萄球菌，对保护人体健康也是有益的。这些菌群与皮肤一道，构成一个完整的皮肤微生态系统。
（二）可对人体健康构成威胁的微生物，称为致病微生物。日常生活中，可能接触到的致病微生物主要有：
人体中：葡萄球菌、链球菌、大肠杆菌、绿脓杆菌、变形杆菌、无芽孢厌氧菌、流感病毒、腺病毒、麻疹病毒等；
食品中：肉毒杆菌、沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、副溶血弧菌、大肠杆菌、甲型肝炎病毒、轮状病毒等。
