当然有关系。
国税函[2009]617号：
一、增值税一般纳税人取得2010年1月1日以后开具的增值税专用发票、公路内河货物运输业统一发票和机动车销售统一发票，应在开具之日起180日内到税务机关办理认证，并在认证通过的次月申报期内，向主管税务机关申报抵扣进项税额。
根据以上规定，当月认证的增值税专用发票，次月申报期内没有向主管税务机关申报抵扣进项税额，就不能再抵扣了。
当然有关系。
国税函[2009]617号：
一、增值税一般纳税人取得2010年1月1日以后开具的增值税专用发票、公路内河货物运输业统一发票和机动车销售统一发票，应在开具之日起180日内到税务机关办理认证，并在认证通过的次月申报期内，向主管税务机关申报抵扣进项税额。
根据以上规定，当月认证的增值税专用发票，次月申报期内没有向主管税务机关申报抵扣进项税额，就不能再抵扣了。
