一些企业成本管理体系松散落后，未形成科学管理体系，十分不利于对企业宏观决策和执行。首先体现在部门分工不够明确、权责不一致，在执行成本控制时相互推卸责任，或者权力泛滥分工过细导致相互意见不一致，损害企业整体利益。其次体现在企业在制度制定上侧重于生产成本控制制度，很少涉及生产前设计、采购和生产后运输、销售环节的制度制定。采购成本过高或片面追求低成本而忽视了原材料质量，这样就十分不利于企业健康发展。销售费用控制力度缺失同样会压缩企业利润空间。再者，企业整体缺乏相应的成本控制反馈机制。企业的运营活动是完整的整体，在项目结束后或一个固定期间对该时期成本控制结果缺少客观总结，对成本控制中的得与失、企业人员的成效与不足缺乏公示，对超出目标预算的成本资源浪费缺少相应的惩罚制度，对做到有效控制成本的人员缺少应有的奖励，不利于提高员工成本控制积极性。最后，有制度制定的企业往往在实施的时候流于表面，根本无法落实。
（三）成本会计核算失真
一方面，成本控制本应该作为企业生产经营的重要部分得到实践，然而企业缺少对现代成本理论的掌握，没有意识到控制成本是企业内部的事情，仅仅根据国家出台的相关法律规定进行会计核算，企业缺少自身的制度规定。尤其一些企业只注重眼前利益，对会计信息进行造假处理，虚高盈利或者压缩利润进行不正当收益。另一方面，企业内部对管理者的约束不规范，成本信息的透明度太差，也会影响成本信息的真实度。会计成本信息失真直接影响企业对下一项目成本控制的事前预测，也不利于企业长期的健康发展。
（四）目标不够科学，缺乏长远规划
随着科技进步和先进技术的使用，生产环节的成本在总成本的比重下降，开发和销售的成本上升，忽视这些环节成本控制的企业只重视眼前利益，损失了企业的长远利益。有的企业缺乏对市场的长远考虑，一味压低成本扩大产量，导致大量产品找不到市场，产品积压影响企业流动资金的周转，造成企业流动资金的浪费。长远考虑的缺失还体现在企业往往意识不到品牌和口碑带来的效益，只关注成本而降低产品质量，最终给企业带来不可挽回的后果。部分企业的战略定位错误，对市场的错误预测也会使整体生产出现偏差，造成资源浪费。
