国务院（也叫中央人民政府）是我国的最高行政机关； 最高人民法院是我国的最高审判机关；最高人民检察院是我国的最高法律监督机关。
1、上述的“一府二院”，根据宪法的规定，互相独立，各自依法履行其职能，互相之间没有隶属关系，没有领导与被领导的关系。
其中，国务院领导全国行政机关；最高检领导全国检察机关；而最高法与下级各法院之间，没有领导与被领导的关系，所有法院均应当独立审判。
2、“一府二院”，都由全国人大产生，对人大负责，在每年3月召开的全国人民代表大会上，国务院、最高人民法院、最高人民检察院 都必须向全国人大汇报工作并接受审议。
3、政府行政行为违法的，行政相对人可以提起行政诉讼；行政机关或工作人员涉嫌单位犯罪或职务犯罪的，人民检察院可以立案侦查，并提起公诉；最终由人民法院依法作出判决。
人民检察院与人民法院，根据实际情况，都可以对行政机关发出司法建议书，对行政机关的行为提出建议，或进行法律监督。
