被选为最佳答案的那个是骗子，不过也有一部分是正确的，那个白金山的其实不是真正的小智，那个“小智”其实是一个借助了火箭队科学家所研制的喷雾剂而变为人形的怪物。（也不想想觉得奇怪吗？你点击那个小智只有一串省略号，打完后还是一串省略号，因此可以判定）游戏真正的最后情节如下：
在打败那个“小智之后”去做球老爷爷家，他家房屋后面有棵树，那里面是做一种球的道具，拿到之后，找做球老爷爷做球，需要等待1天，然去收集全部图鉴，收集完毕后，再回到白金山，进入最深处里面有个机关，具体在哪我就不清楚了。打开机关后，需要集齐所有精灵图鉴才能进去，到里面你会发现一直神秘的精灵他就是雪拉比，你走到精灵面前后，突然出现了一个红发男孩（也就是在第一世界中你的宿敌），刚见面他就要和你打，打败他之后，他并没有走开，然后你跟着他与雪拉比对话，可是雪拉比被那个红发男孩弄得很生气，发动了时间转换，你会发现你来到了一个时间迷宫，很难走（慢慢摸索着过去吧）迷宫有个出口，走出出口，你会发现一个带行全新的世界（不过不是谣言中的第三个世界），进入这个世界后，一个女孩出来和你对话，然后和你切磋，打败她之后她会带你进入时空之塔，告诉你有关精灵大赛的事，然后你去报名。决斗开始了，打败一个个强劲的对手吧，在最后四强时，突然地面发生了震动。怎么回事呢？接下来就是剧情了，天空中突然出现了两只超强的精灵（名字我记不清了，不过记得他们是时间守护神和空间守护神）这是，一个老爷爷发话了，有两只精灵一直掌管着时间，另一只掌管着空间，这两只精灵分别在时间与空间中穿梭，几万年会出现一条时间裂缝（估计是你刚刚走的很复杂的迷宫），在这时，这两只精灵并会相遇，而且异常愤怒，不把对方打到是不甘心，他们就一直打，时间守护神不相信发出绝招冲向那个女孩，在这时跳出了一直精灵挡住了攻击，但那只精灵身受重伤，然后你很愤怒去打这两只精灵，但根本打不过，他们无视一切，直接把你的精灵秒秒杀，然后这个女孩哭了，说了一大段话，两大守护神仍然不在乎，这是那位老爷爷说出了方法，于是你就去时空之塔的塔顶，启动音乐盒，好听的音乐消除了两只精灵的仇恨，停止了战争，这个即将毁灭的城市又重新修复了，然后那个拉爷爷就把震市之宝（一个技能，破坏死光）给了你，然后你一直往前走出了时空之城，进入一个冰雪世界，在最深处你会发现雪拉比这时红发男孩也来了，但是还有一个神秘人，你打败他之后，他会告诉你他是火箭队的人，使用时空穿梭机来这里杀雪拉比的，这是那个红发男孩就把这个人杀了，雪拉比很感激你，又一次发动了时空穿梭。 将你和红发男孩送到了那个当初打四大天王的地方，然后雪拉比走了，这是来了一个黑衣的人（就是当初五大天王中最厉害的那个，现在称他为阿渡），他以为你是火箭队的人就要来打你，你会发现，这个人已不再是当初的实力了，精灵还是一样，但是实力提升了一倍多，很强大，打败他之后你向他解释，他这才想起你来，于是把你拉到一个隐蔽的地方告诉你火箭队已经占领了所有城市，正在大肆破坏，而且还有一个惊天的阴谋，然后他就走了。接着你就去真新镇大木博士家，发现他没在，只有一个小茂，从小茂口中得知大木博士被火箭队的人抓，然后小茂打开一条秘密通道，你跟着他进去，到了分岔口他离开了，这时红发男孩（宿敌）出现，打败他之后，他就走了，你往不同于他们2个人的方向走去，在最深处，你会发现一个男孩被绑着，你去解开身子，这是来了五个火箭队的人，你一一将他们打败，从男孩口中得知，他信大就是真正的小智，他会把你精灵恢复活力，然后他说要去组织火箭队就走了，然后你再次回到分叉口，发现小智，然后你跟着小智走，来到火箭队的秘密基地，这里面全部都是精英的火箭队成员，个个都很强大，不过你不要担心，以你的实力对付他们绰绰有余，到门口小智进去了，然后你也进去，两个守卫拦住你，打败他们把，然后你就一路杀到底，到了第一层的蠢坦哗最里面，有一个火箭队的高手自称是火箭队的四大护法之一，你打败他之后，进入第二层，然后你继续打进去，到最里面，你会发现宿敌，他说不会输给你的就走了，然后你进去，挑战并打败第二个人护法。接着走到第三层，阿渡正等着你呢，他把你精灵的活力补满了，然后你们分头行动，一直打到最后，出现了第三个护法，这个护法的实力非同小可，你发现小茂也在，然后你去挑战第三个护法，发现他只有5只打败他之后，他会说：“不错嘛，看看我的真本事把！”然后他就拿出他的最后一只精灵（黑色暴鲤鱼龙），小茂和阿渡接连被打败，然后你费劲九牛二虎之力，终于打败了他，进入了第四层）一路杀到底，最后杀到了最里面，第四个护法可是很强的，你根本打不过他，被打败之后，小智进来了，进过一番厮杀也败下阵来，接着他要杀你们，这时凤凰和洛奇亚出来了，然后你用他们打败了第四个护法（不管你先前有没有这两只，但这些都是剧情），来到了第五层（奇怪怎么一个人也没有）来到最里面的门口，小智帮你把精灵的体力都恢复了，然后你进去，终极大BOOS在等着你呢，然后看小智和他打，发现他只有2只精灵，但别小看他们哦，这两只全部是黑色的精灵，很厉害，连小智也输了，接着阿渡出现了，和他打又输了，小茂出现了，又输了，然后叫你快走，你出了房间撞上了宿敌，他说了一句胆小鬼就进去了，然后你继续往右走，突然掉到了一个地方，在里面你发现了很多只精灵被关着（都是分开的），里面有个人被绑着，你去解开他，才知道他就是大木博士，这时，一个神秘人出现了，大木博士叫你快跑，你没跑，去和这个人打了起来，打败他之后，他就跑了，然后大木博士告诉你，火箭队正在秘密炼制黑暗精灵，那些容器就是炼制黑暗精灵的容器，然后他给你一个东西（好像是用来对付黑暗精灵的），他就走了，然后你回到房间里和终极大BOOS（火箭队队长）打架，终于将他击败，将小智他们解救，那个火箭队队长就说有本事到第六层会会他，就走了。然后你们来到第六层，那里地形复杂，于是你们五个人就分头行动，你会发现这里面的火箭队成员特别多，也特别厉害，基本上都是黑暗精灵，不过没关系打败他们把，来到最里面的入口，你们五个人会相遇，这是你的精灵体力就全部都恢复了，进去好，你会发现四大护法都在，不过没关系，第一个护法红发男孩（宿敌）说他会解决，第二个护法，小茂说交给他了，第三个护法阿渡来挡，第四个护法小智去应对然后你就一直走到最里面，和终极大BOOS展开较量，你打败他之后，他会冷笑一声，召唤出他的终极精灵，这是，一只全身披着黑盔甲全身冒着黑暗气息的神秘精灵出现了（看过神奇宝贝的人都知道那只精灵就是终极梦幻，只不过现在这只还加上了黑暗能量）这是凤凰飞回来了，第一回合就被终极梦幻打趴在地，然后你很愤怒，但是终极梦幻的念力是原来的100倍，你的精灵只能白白挨打不能还手，突然地面发生震动，一道光束从天而降，一只精灵顺着这道光束出现在眼前，他就是雪拉比，他发动绝招你的全部精灵都强化了，继续去打终极梦幻终于将其打败，终于打败火箭队了。然而还没有结束，邪恶气息还在散播，甚至比之前的更浓，小智等人也回来了，但是受伤惨重，雪拉比将他们恢复了，众人向第七层进发，做好生死的准备了吗？让我们一起去神秘的第七层吧。到了第七层，发现里面有很多人型怪物，将他们一一打败把，到了里面，有一个和小智一模一样的人站着，小智异常愤怒，将他打败，打他却不是人性怪物，它是一只精灵（黑暗梦幻）变成的，接着在实验室发现的那个神秘人出现了，露出了真面目，这是你会发现这个神秘人就是你当初在丹波市发现水君后出现的那个神秘人，他又召唤出了一只恶系精灵（达克莱伊），将你们全部催眠，当你们醒来后发现都被绑在柱子上，雪拉比被捉去了，这是凤凰出现了，将你们救了，然后你依次打败达克莱伊和黑暗梦幻，但这个神秘人没有半点慌张，他使出了他的终极精灵，竟然是洛奇亚！！！！！！！！！！！！（但是这只洛奇亚是黑暗洛奇亚，被黑暗化了），雪拉比和凤凰都被打趴在地，你们五个人去和他打，精灵全部都被秒杀！，正在你们绝望的时刻，雪拉比将你的绳子打断叫你快跑，你忍痛逃跑了。接着你就顺着楼梯跑到最后一层（但不是第8层），大木博士出现了，他气喘吁吁地说：“要打败黑暗洛奇亚只有一个办法，就是找到光之石“，于是你就去这最后一层的最里面有一个空间，你进去，里面只有一个老人，你去与他对话，听到消息后，他说他要试试你的实力，于是他就变成了原形，居然是创世神阿尔宙斯！！！！！！！！，不用说了，你是绝对打不过他的，打输了之后，他大笑，说了一大段日语看不懂，之后就把光之石交给了你，然后离去了。拿到光之石后往回走，发现大木博士正被一个人狂虐，这个人就是那个黑暗博士的最强机器人，你依次打败他的5之精灵后，他拿出了最后一种终极精灵，竟然是冥王龙！！！接着大木博士会给你一样东西给精灵装上就可以打败他了，然后和博士一起回到第七层，发现雪拉比正在被魔化，于是你就拿出光之石，这是凤凰好像和光之石有缘似的，光之石与凤凰合二为一，凤凰终极进化成了光明凤凰与黑暗洛奇亚展开了较量，在这期间，你去打败黑暗博士将小智们和雪拉比救出，接着拿光明凤凰打败黑暗洛奇亚吧，最后那位黑暗博士启动了自爆系统，雪拉比发动了时空转换，接着水晶版就真正地结束了
