劳动保障部发的是职业资格证书，有相关的法律法规背景（国家职业资格证书制度），盖有国徽印章。全国通用，国际互换。
中国物流与采购联合会颁发的证书只是一个行业协会发的证书，在行业内认可，行业外就难说了。没有法律背景支持，应用范围比较窄。
证书，主要面向基层操作人员，这两个证书不矛盾，各有分工。
扩展资料：
物流师证的种类：
1、劳动部 。
2、中国物流与采购联合会、全国物流标准化技术委员会 。
3、国外的洋认证，比如美国的CIA认证协会，英国的皇家物流协会 权威性：物流师这个词具体来说是我国入世之后才兴起的，随着入世之后全球经济的一体化要求。
我国的一些行业开始涌现自己的行业证书，物流师资格证在这样的背景下应运而生。我国政府速度成立了中国物流与采购联合会和全国物流标准化技术委员会，这是个跨政府跨行业的部门。
在国内开展组织培训和考试。实行全国统一教材、统一认证、统一考试、统一培训等六统一的原则，实行考培分离的制度。
4、2005年05月01日。中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局和中国国家标准化管理委员会共同发布了GB国标――物流企业分类与评估指标。指标中明确要求将物流企业划分成1A至5A五个级别。
参考资料来源：百度百科-物流师证书
参考资料来源：百度百科-中国物流公司
参考资料来源：百度百科-中国物流与采购联合会
