明朝中叶，皇帝年少，朝野腐败。大太监李瑾忠把持朝政大权，人称“九千岁”，他不但诛杀异己残害忠良，更与倭寇勾结,鱼肉百姓。洪州的惠王收集了九千岁的通倭罪证前往京城，希望能在皇帝和百官面前一举扳倒九千岁。为保护惠王安全，初出茅庐的杨恕和华安众僧一路护送。在艰苦的护送途中，杨恕结识了锦衣卫将领马千秋与惠王之子朱辰钧，三人惺惺相惜，结为兄弟，共同对抗九千岁。狡猾的九千岁没有坐以待毙，他不断派出刺客，企图销毁一切证据。一时间，京城里充满了明争暗斗。九千岁凭借权势，成功抹杀了惠王带来的证据，令惠王陷入束手无策的绝境。杨恕并没有放弃，他历经艰辛考取武状元，在九千岁的层层阻挠下取得了最关键的罪证密信。有了密信，就等于掌握了绝地反击的杀手锏，杨恕和惠王都认为胜利在望了。不料最后关头密信被人窃取，九千岁布下陷阱，反而令惠王等人背上了叛乱的罪名。惠王被迫自刎，杨恕协同朱辰钧逃往华安寺避难。
九千岁消灭了心腹大患，气焰更甚从前。而杨恕的结义兄弟马千秋居然背叛兄弟情，成为了九千岁的爪牙，并亲自前往华安寺抓捕了朱辰钧。为拯救朱辰钧，愤怒的杨恕踏上了追击马千秋的道路。不料马千秋却处处相让，杨恕这才明白，马千秋是迫于形势，忍辱负重潜伏在九千岁身边。为了能最终扳倒九千岁，马千秋在结义兄弟面前自残身体，令杨恕钦佩。随后，杨恕三兄弟里应外合潜伏在京城寻找九千岁的罪证。终于，杨恕发现了九千岁的最大秘密：当年，九千岁制造了一起宫廷命案，并亲手杀害了皇帝的生母。此事揭出，众怒之下九千岁必然倒台。杨恕从东厂大狱中救出了目睹此事的人证，并证实九千岁企图谋朝篡位，最终取得了皇帝的信任。得知事情败露的九千岁狗急跳墙，杀入皇宫，杨恕及时带领援兵赶到，挫败了九千岁的进攻，显赫一时的九千岁终于落得个抄家问斩的下场。
九千岁之死，使得朝廷恢复了秩序，但沿海倭寇势力更加强大，屡屡进犯边境，洪州百姓民不聊生。杨恕随同靖海将军谢天顺接受皇命前往洪州抗倭。倭寇头目设下埋伏，企图将谢天顺截杀于半路。杨恕悉心护卫，成功识破了倭寇的诡计，保卫谢天顺安然抵达。谢天顺指挥谢家军一举击溃了倭寇的主力，洪州获得了暂时的安宁。 然而，真正的危机刚刚降临。继任为惠王的朱辰钧对皇帝的削藩政策感到不满，野心勃勃地秘密筹备谋反行动。为了积攒实力，朱辰钧不惜出卖国家与倭寇合作，并企图得到能统领天下僧兵的华安宝物僧兵符。为夺取僧兵符，朱辰钧杀死了马千秋之父，并嫁祸给杨恕。马千秋不明真相，追杀蒙冤的杨恕。在经历了痛苦的兄弟相残之后，马千秋最终发现了自己是被朱辰钧欺骗和利用，与杨恕尽释前嫌。兄弟重新联手，共同对抗朱辰钧。曾经的三兄弟，就此走上了截然相反的道路。 朱辰钧设下鸿门宴，企图杀死谢天顺，以铲除谋反之路上的最大障碍。杨恕、马千秋洞悉朱辰钧的计划，及时赶到援救。朱辰钧冷酷无比，对兄弟二人痛下杀手。谢天顺带领谢家军与朱辰钧展开了全面对垒，不料朱辰钧已经买通了谢天顺的手下大将与朝廷大臣，以皇帝名义降旨让谢天顺回京请罪，谢家军面临支离破碎的局面。为顾全大局，谢天顺将谢家军托付给杨恕，自刎明志。杨恕在困境中鼓舞士气，在危难中力挽狂澜，谢家军的大旗巍然不倒。在华安僧兵和谢家军的联合攻击下，朱辰钧退守洪州城。杨恕和朱辰钧在洪州城外展开了最后的对决。最终，杨恕及时发现了朱辰钧暗度陈仓的计划，将朱辰钧的叛乱部队一网打尽。 三兄弟清算着恩怨情仇，朱辰钧的野心在杨恕和马千秋的联手作战下彻底粉碎。
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