集团公司：资产管理部（财务部、固定资产管理部、投融资管理部、审计管理部），行政事务部（药品注册部、市场信息部、企业策划部、法律事务部、人力资源部、办公室）
板块划分：科研(悦康药业集团北京药物研究院、悦康药业集团企业技术中心、悦康抗生素工程技术研究中心)，医药原料（安徽生物制药产业园、安徽天然制药有限公司），制剂（悦康药业集团制药总厂、悦康药业集团上海制药有限公司、广州悦康生物制药有限公司），国际贸易（北京悦康润泰国际商贸有限公司），流通（北京悦康医药物流有限公司）
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