2001年
悦康药业集团在北京正式注册成立，第一家生产型企业（集团药厂）在北京经济技术开发区落户，形成了以医药研发为核心，自主产品为主导的产业模式。
2008年3月
悦康药业集团与尼日利亚FIDSON（菲森）药业公司及香港科迪健康公司共同参与的悦康中非合作建厂项目——尼日利亚YFK药业有限公司在北京钓鱼台国宾馆举行签字启动仪式，共同在尼日利亚莱基自由贸易区投资设立制药厂。届时，悦康药业将给非洲人民带去质优价廉的药品，缓解当地缺医少药的情形。
2008年底
金融危机肆虐全球，大量企业降低员工薪资、裁员。悦康药业集团逆势而上，于伟仕董事长创造性地提出“不裁员、不降薪、不停产”的“三不”原则，并为社会提供了近千个就业岗位，为此，公司荣获了由国家人力资源社会保障部、中华全国总工会、全国工商联联合颁发的“保障社会就业全国先进民营企业”称号。
2009年4月25日
中共中央政治局委员、北京市委书记刘淇同志率北京市委、市政府调研团就应对金融危机促产业发展专题赴悦康药业集团视察指导工作。期间，刘淇同志对悦康药业在“保增长、促稳定”方面的突出贡献表示极大的赞赏。
2009年10月16日
为了增强医药物流的专业性，保障药品质量。以“心系百姓健康，打造专业物流”为宗旨的“北京悦康医药物流有限公司”成立，目的是保质保量、快捷周到地将药品运送到用户和患者手中，建立一个完善、节约、快速和服务于全国的医药企业、成为具有强大市场竞争力的医药物流企业。
2010年1月16日
位于安徽省太和县的“悦康药业集团安徽生物制药园”奠基，该项目建成后，将采用当今国际先进的生物制药技术，对促进当地社会就业和产业结构调整有着重要意义。
2010年3月
集团三期办公楼正式启用，总占地8895平方米，包括九层综合性研发办公楼及美国FDA标准化制剂生产大楼。
2010年4月
在北京市委、市政府的大力支持下，悦康药业集团先后入选中关村国家自主创新示范区首批“十百千工程”百亿级重点培育企业，北京生物医药产业跨越发展工程首批G20规模企业。
