用无纸化通关模式申报的，出口退税操作流程不变。
有电子口岸的企业办理流程：
1、网上申领核销单(电子口岸——出口收汇——核销单申领)
2、 进入国税系统输入报表及纳税申报表
3、将出口货物退(免)税申报系统里的免税数据上传至国税网站
4、 出口货物退(免)税申报系统进行退税申报(申报成功后另存入U盘)
5、准备出口退税纸质材料(具体见出口退税资料封底)并带U盘到国税局申报
6、等国税局电话通知拿退税批复
7、等国税局电话通知,去国税局办理退税申请手续(带退税批复、公司公章及印鉴章)
8、一般办理过退税手续一周内银行从国家金库里拨入账款至公司帐户
无纸化退税的核心实现了核销单电子化，也就是核销单取消了，但是退税联还是存在的。
