1、中央
东汉中央政府的官员分省官、宫官、外官三大系统。内官、外朝的区分古已有之，而在宫廷之中，皇帝日常起居的区域称省中（亦称“禁中”），因此内宫官员中又有宫官与声官的区分。
在皇帝身边执役、照顾皇帝日常生活的是宦官，省中的宦者均隶属黄门令管辖。省内的禁卫工作亦由宦官但任。
尚书台是皇帝的秘书机关，其官署设在宫廷之内、禁省之外。它的主要执掌是管理章奏文书、起草诏令，但实际上政务都由上书抬代表君主执掌，权力极大。上书台设长官（令）一人、副长官（仆射）一人，下设尚书六人分十八人。沟通上书台与皇帝联系的官员有侍中、中常侍、黄门侍郎等。其中，侍中由士人充任；中常侍、黄门侍郎则由宦者承担。侍中有事才入禁省，中常侍、黄门侍郎则日常居住在省中，因此，虽然三者之中侍中的级别最高、中常侍次之，但与君主的亲密程度，则以中常侍为最。宫内省外的禁卫工作由九卿中的光碌勋与卫尉负责，光碌勋偏于内，卫尉偏于外。光碌勋下属五官、左、右、虎贲、羽林等五名郎将，中郎将以下有中郎、侍郎、郎中等官。光碌勋的禁卫力量是郎官，卫尉的禁卫力量是武装卫士，所以，卫尉在宫卫事务中的地位相当重要。
外官主要有三宫九卿，他们是中央政府的主要行政官员。
三宫指太尉、司徒、司空，他们的品级最高，名义上的职责是辅导皇帝主持国家政务；三公之上还有太傅，其职责辅导皇帝，但不常设。东汉的实际政务都同属尚书台，因此，三公、太傅如没有“录尚书事”的头衔，就是没有实权的虚职。三公的属官有长史一名，掾属、令史、御属各二、三十名。其中，长史是三公的主要副手，掾、属是分管具体事务的部门负责人（掾是正职，属是副职），除长史由朝廷任命外，其他属官均由三公自行聘用。
九卿是太常、光掾、卫尉、太仆、廷尉、大鸿胪、宗正、大司农、少府。他们各自分管的政务是：太长掌典礼，光碌勋、卫尉掌宫省禁卫，太仆掌皇帝车马，廷尉掌司法，大鸿胪掌接待诸侯与少数名族，宗正掌皇族事务，大司农掌国家财政收支，少府掌皇帝器用服饰。九卿各官的长官是卿，副职为丞；其下分设各官管理具体事务，大体以令为正职，丞为副职。
与九卿级别相当的外官（亦称“列卿”）还有执金吾、将作大匠、大长秋等。其中，执金吾负责宫廷之外、都城之内的治安（都城门另有城门校尉负责守卫），将作大匠负责宗庙殿堂、宫室陵园等土木工程，其副手为丞，下属的部门负责亦以令为正职，丞为副职；大长秋主管皇后事物。性质与就卿中的少府类似，由宦者担当。皇位继承人太子正式确立之后，有专门隶属太子的东管宫。其设官大体与政府类似，但分级没有后者细密。东宫官职均冠“太子”，如太子太傅、太子少傅、太子家令等。
在军事方面，相当三公的中央高级官员有大将军、骠骑将军、车骑将军、卫将军，相当九卿的有前、后、左、右将军，均不常设。其属官与三公相同，唯在长史之下另有司马一人，主管军务；从事中郎二人，职掌参谋，均由朝廷任命。将军直接领兵的，在部、曲、屯等建置上分别设校尉、司马、军侯、屯长等统兵官。
常备军由中央与地方军（郡国兵）组成。中央军中，京师卫戍部队由城门校尉统领，野战部队（北军）由北军中侯统领。北军下辖五个兵种的部，番号分别为屯骑（骑兵）、越骑（特种兵）、步兵、长水（水军）、射声（弓箭）。长官为校尉，副职司马。全军总数约五千人不到。北军平十卒驻屯在京城长管君主宿卫、助理首都治安，发生战事就成为组建出征步枪队的核心。地方上的郡国兵经东汉初期多次裁撤、削减，只剩下边郡与内地关隘的少数驻军。遇有战乱，都是临时募兵或抽调京师北军出战。
2、地方
东汉的行政区分为郡（国）、省二级。郡之上还有监察区性质的州。
州的长官为刺史（中平五年改称州牧；京畿地区的司隶部长官特称校尉），其主要职责是巡察下属郡国政务，年终遣吏到京城向司徒府汇报（上计），劾奏不称职的郡国长官。属官有从事（亦称掾史）、假佐。从事有治中从事、别驾从事、簿曹从事、兵曹从事、部郡国从事等，均由州长官自行聘用。治中别驾是州长官的主要助手，在从事中地位最高；簿曹掌文书；兵曹掌军事，仅在有军务时设；部郡国从事，每郡国一人，负责纠劾郡国长官、按治郡僚属，其地位仅次于治中、别驾。假佐是州长官的低级属官，主管文书，其中的典郡书佐分管州所属郡国的有关文书，每郡一人，由郡史轮流充当。
郡的长官称太守（因太守兼领武事，故别称郡将；州治所在郡的长官称尹），根据郡的大小、没恶，太守的级别有中二千石至八百石六级。郡内原设有专掌军事的都尉，在建武六年之后，边郡常设，内地大多不设。每郡的都尉，为一至五千人不等。都尉在一人以上时，在郡之下分设都尉辖区。有时，在不足设郡的地方，亦设置过渡性的都尉区（属国都尉）进行管理，其性质相当小郡。郡太守助手为郡丞（边郡为长史），由中央任命。此外，郡府的僚属有：功曹，掌管郡内一切人事；主簿，掌管文书；督邮，主管纠察属县、监管本郡官民；掾、史‘，分曹办理郡政，掾为正职，史为副职，每曹有办理文书的书佐。又设三老，帮助推行政施和教化。郡府僚属由郡太守自行聘用，其的位以功曹最高，依次为主簿、督邮等。郡都尉的僚属与太守类似，亦由郡都尉自行聘用。
分封给诸侯王的郡称国，其行政级别与郡相等。王国的官属分两个系统，一是类似于郡官的民政系统，有相（相当太守）、长史（相当都尉），其属官亦与郡大体相同；一个是管理诸侯王生活、禁卫的官属，如郎中令（相当光禄勋）、仆（相当太仆）、治书（相当尚书）等。此外，王国还设有类似于太傅的傅，负责辅导诸侯王，级别等同于王冠相。
分管少数民族的使匈奴中郎将、护乌桓校尉、护羌校尉，级别与郡太守相当，其属官有从事、掾，无定员，根据事务多少而设。
县的长官为县令或县长，级别从千石至三百石不等。下设属官有；丞一人，管理文书、仓狱；县尉一至二人，管理治安；主簿、功曹、掾、史，均与官类似；三老，掌教化。县的长官由朝廷任命，但州郡也可以过问县的人事，县长官或丞、尉出缺又无合适人选的，上级机关可派出属官或另行任命他人代理。县长官的行政事务，受郡府的监督，每年年终要向郡长官汇报功作（上计），听侯考核。
分封给列侯的县称侯国，其行政级别与县相等。侯国的官属也像王国一样分两个系统：主管民政的是国相，相当于县令或县长，仅负责向列侯交纳租，行政上则听命于郡；列侯的家臣有家丞、庶子各一人（不满千户的侯国不置家丞）。
此外，与县的级别相当的地方行政单位还有道（境内有少数民族的县）、邑（封赐给公主的县）及郡所设的盐官、铁官、工官、都水官。道、邑的官属与县、侯国差不多，郡在县境所设盐铁工官等，由县暑调拨属官理事，不另外设置官属。
县以下的行政单为有乡、亭、里，大体是百户为一里，十里为一停，十亭为一乡。乡的长官为秩、啬夫，令有游徼掌治安、乡佐收税、三老掌教化；亭设亭长主管治安，令有亭侯、亭卒；里的长官为里魁。乡、亭、里的官员一般由郡、县等上级机关任免
大将军：战国时始置，是将军的最高封号，东汉时多由贵戚充任。具体名号有建威大将军、骠骑大将军、中军大将军、镇东大将军、抚军大将军等等，除骠骑大将军之位稍低于三公之外，其余均在三公之上。三国时夏侯敦、姜维等人皆为大将军。
大司马：汉武帝（刘彻）废太尉设大司马，光武帝（刘秀）又废大司马为太尉，故大司马即太尉，为掌管军政和军赋的最高官职，即全国最高军事长官。东汉时与司徒、司空并称三公。
大司农：秦时称治粟内史，景帝改称太农令，汉武帝太初元年（公元前104年）更名为大司农。魏初设大农，文帝（曹丕）黄初二年（221年）改称大司农，蜀、吴亦各有大司农。两汉时大司农掌管租税、钱谷、盐铁和国家财政收支，而到了三国时期，由于权力的分散则只能负责这些物资的保管工作了。九卿之一。
大鸿胪：秦时称典客，汉初称大行令，汉武帝太初元年更名为大鸿胪，掌管接待宾客之事。九卿之一。
卫尉：秦时始置，汉景帝（刘启）初更名为中大夫令，不久即恢复原名，掌管宫门警卫。九卿之一。
太尉：同大司马。曹丕即位后任贾诩为太尉。
太傅：辅弼国君之官，作为重臣参与朝政，掌管全国的军政大权。曹睿即位后人钟繇为太傅。
太常：秦时称奉常，汉景帝中元六年（公元前144年）更名为太常，掌管礼乐社稷、宗庙礼仪。其属官有太史、太祝、太宰、太药、太医（为百官治病）、太卜六令及博士祭酒。九卿之一。
太仆：秦和两汉均设太仆，王莽一度更名为太御，掌管舆马及牧畜之事。九卿之一。
太守：秦时设郡守，汉景帝更名为太守，为一郡之最高长官，除治民、进贤、决讼、检奸外，还可以自行任免所属掾史。
少府：秦和两汉均设少府，王莽称共工，与大司农一同掌管财货。不过大司农掌管国家财货，而少府则管供养皇帝。其属官有掌管御用纸、墨、笔等物的守宫令、掌管刀剑弩机等物的尚方令、掌管衣物的御府令、为宫廷治病的太医令。九卿之一。
中常侍：秦时始置，东汉时由宦官担任，掌管文书和传达诏令，权力极大。
中书监令：曹操为魏王时，设置秘书令以处理尚书章奏。曹丕于黄初初年改秘书令为中书令并特置中书监，使之排在中书令之前。
中领军：曹操为丞相后置领军，不久改为中领军，掌管禁卫军。
中护军：曹操为丞相后置护军，不久改为中护军，掌管禁卫军，地位略低于中领军。
长史：秦时始置，西汉时丞相下有两长史，其职务相当于秘书长，即最高国务机关中事务主管。将军幕府中亦有长史，为幕僚之长；可分令部队出战的称为将兵长史。东汉的太尉、司空、司徒三公府亦设长史，职任颇重。三国沿置不改。
从事：刺史的佐官如别驾、治中、主簿、功曹等都称为从事。
仓曹掾属：主管仓谷之事的官员，正者称掾，副者称属。
司徒：西周始置，东汉时掌管教化，三公之一。
司空：西周始置，东汉时掌管水土及营建工程，三公之一。
司隶校尉：汉武帝始置，负责督率京城徒隶，从事查捕奸邪和罪犯，简称司隶。刘备在蜀称帝时以张飞为司隶校尉。
司金中郎将：曹操于建安十年（205）置，掌管冶铁、钱币和农具的铸造的官员。
主簿：汉始置，掌管文书簿笈，司空、丞相府及刺史的佐官中都设有主簿。
功曹：刺史的佐官，掌管考查记录功劳。
东西曹掾属：曹操为丞相后下设东、西曹掌管人事工作，东曹主管二千石官员的任免，西曹主观丞相府官员的任免。其负责人员正者称掾，副者称属。
丞相：战国时始置，为百官之长。东汉不设丞相，建安十三年（208）复置，曹操自任丞相。“丞”与“承”相通，“丞相”就是承君主的旨意来处理国家事务的人。
丞相理曹掾：丞相府中掌管司法的官员。
光禄勋：秦时称郎中令，汉武帝更名为光禄勋。王莽称司中，东汉又称光禄勋。曹操为魏公后设郎中令，黄初元年（220年）又称光禄勋，掌管宿卫宫殿门户。其属官有掌管宾赞受事的谒者、掌管御乘舆车的奉车都尉、掌管副车马匹的附马都尉、掌管羽林骑的骑都尉，而大夫、中郎将等官是否是光禄勋的属官尚有争议。九卿之一。
执金吾：秦时称中尉，汉武帝更名为执金吾。王莽称奋武，东汉复称执金吾。曹魏先称中尉，黄初元年更名为执金吾，掌管宫外巡卫。卫尉巡行宫中，执金吾则徼偱京师。天子出行，执金吾为先导。“吾”当御讲。
别驾：刺史的佐吏，刺史以巡行视察为职，别驾则另乘传车，辅助刺史出巡，故称别驾。
廷尉：秦时始置，汉景帝更名为大理，自后或称廷尉，或称大理。廷尉掌管刑法狱讼，是各地上诉的最高司法机关。“廷”字系直、平之义，治狱贵直而平，故以为号。廷尉的属官有大理正、大理平、大理监，成为廷尉三官。九卿之一。
县令长：春秋战国时始置，一县的行政长官，人口在万户以下的县的长官称为令，万户以上的称为长。县令长的佐官有掌管军事、治安的县尉和掌管文书、仓狱的县丞，一般每县有丞、尉各一人，大县有尉两人或更多。
尚书：“尚”就是执掌的意思。秦汉时，尚书只是少府的属官，掌管殿内文书，地位很低。汉武帝时，设尚书五人，开始分曹治事，因在皇帝周围办事，地位逐渐重要。曹魏有吏部、左民、客曹、五兵、度支共五曹尚书。吏部又称选部，掌管选用官吏；左民掌管缮修功作、盐池园苑；客曹掌管少数民族和外国事务；五兵掌管中兵、外兵、骑兵、别兵、都兵；度支掌管军国支计。其中以吏部尚书最为重要。
尚书令：秦时始置，为尚书台首长，是直接对皇帝负责、掌管一切政令的首脑。尚书令的副手为尚书仆射，曹魏置尚书仆射一或二人，二人并置时称左右仆射。若尚书令缺，由左仆射代行令事。曹魏时以五曹尚书、二仆射、一令为八座。
尚书郎：尚书台内负责起草文书的官员。东汉选孝廉中有才能者入尚书台，满一年称尚书郎，三年称侍郎。
侍中：秦时始置，为丞相的属官，掌管拾遗补缺、赞导、陪乘、出而负玺以及照料皇帝日常生活等事。
宗正：秦时始置，王莽称宗伯，东汉复称宗正，掌管皇族与外戚事务。两汉皆以刘姓宗室充任。九卿之一。
征东将军：统领青、兖、徐、扬四州，屯驻扬州。
征南将军：统领荆、豫二州，屯驻新野。
征西将军：统领雍、凉二州，屯驻长安。
征北将军：统领幽、冀、并三州，屯驻蓟州。
刺史：秦时始置，掌管一州的军政大权。刺，检举不法；史，皇帝所使。
治中：刺史的佐吏。古代簿籍文书之类称为“中”，“治中”即为管理文书档案之意，后来逐渐演变为一种固定的官职。
参军：东汉末曹操以丞相总揽军政，其僚属往往以参丞相军事为名，即参谋军务，简称“参军”。
河南尹：东汉建都于河南郡洛阳县，为提高河南郡的地位，其长官不称太守而称尹，掌管洛阳附近的二十一县。
典农中郎将：汉末曹操置典农中郎将和典农校尉，均掌管农业生产、民政和田租，仅有所治郡国大小之别，职权相当于太守。
城门校尉：西汉始置，掌管京师城门的屯兵。
相国：即丞相。
将作大臣：秦时称将作少府，汉景帝更名为将作大臣，掌管宫室、宗庙、路寝、陵园地土木营建。
给事中：秦时始置，西汉沿置，东汉省，魏复置。为将军、列侯、九卿，以及黄门郎、谒者等的加官。
都督：三国始置都督和大都督，为领兵官，其中大都督为最高军事统帅。
校事：曹操临时设置的小吏，负责伺察群臣的微过小罪。
监冶谒者：三国时魏置，掌管冶铁的专官
御史大夫：掌管弹劾、纠察的官员，其位仅次于丞相。
御史中丞：御史大夫的副手。
黄门侍郎：秦汉时，宫门皆黄色，故号黄门。黄门侍郎因在黄门内供职而得名。
散骑常侍：三国魏置，即汉代散骑（皇帝的骑从）和中常侍的合称，在皇帝左右规谏过失，以备顾问。
督军：高级统兵长官，位在相国、太尉、御史大夫之下。
督邮：汉代各郡置督邮官，掌管督察纠举所领县乡违法之事，兼管宣达教令、讼狱捕亡等事。
