水质的好坏，关系着鱼虾的生长。碱性大的水塘养殖什么样的鱼类都不好，需要净化鱼塘的水质，重新给鱼虾一个良好的生长环境。有条件的可以用换水的办法降低碱性。鱼塘较大不方便添加新水，就只有花钱用偏酸性水质改良剂（或碱性）来调节，要弄清楚水质偏碱性（酸性）的原因，从根源上着手处理和预防水质发生改变。
一般情况下，鱼塘要保持良好的水质。如果水质不好，应该采取净化办法。净化水质的方法除了传统的方法（注水、使用增氧机、施生石灰）外，还有一种新的方法，使用水质调节剂：微生物菌肥。微生物菌肥内含多种功能微生物，可以有效分解各种有害物质。当水质过肥、浑浊、透明度低时，施用适量微生物菌肥，可以保持水质澄清，防止水质老化，促进浮游生物生长和预防鱼病的发生。此外，与传统方法相比，使用微生物菌肥还可以给鱼虾带来丰富的“天然”食物。微生物菌肥中的功能微生物可以分解水草、残余饲料、粪便垃圾等，形成鱼虾所需的养分，供其食用。施用微生物菌肥后，水中浮游生物大量繁殖，池水呈现绿色或褐绿色，效果十分理想。
