总体来说，合作医疗、住院医疗、综合医疗的区别是：
1、综合医疗保险不仅提供门诊医疗服务费用补偿，而且提供住院医疗服务费用补偿，不分大病、小病和重病、轻病都提供医疗保障。
2、合作医疗（俗称劳务工医疗保险，现在改称农民工医疗保险），看门诊需要到绑定社康看病，
住院待遇相对较低。2008年底放宽了，由以往一家企业只能绑定一家，变为可绑定其经营所在地的多家定点社康。
每个月交的费用有区别：
1、综合医疗保险：个人交2%，基数最低为1940（按3233元*60%算），每个月从工资中代扣39元。单位交7%(综合险+地方补充+生育保险)即136元。个人和单位一共交费174.2元/月。 综合医疗保险最全面，包括门诊、住院、生育保险。可以任选一家定点医疗机构就医。每个月交的费用要比住院医疗、合作医疗多很多。
2、合作医疗（俗称劳务工医疗保险，现在改称农民工医疗保险）：个人出4元，单位8元，看门诊也是需要到绑定社康看病。
