无法稳定办公输出的保证
通常灌粉最显著的弊端就是高故障率。由于硒鼓的制造需要很高的技术，这也是硒鼓工作过程稳定、可靠的保证。而硒鼓漏粉首先是影响打印机的性能，严重时会损坏打印机。碳粉漏到搓纸轮和分页器那里，会造成不上纸和一次打几张出来，如果漏到电路板那里，碳粉的导电性会造成电路板烧毁。
类似的故障对用户造成的损失往往是无法估量的：频繁的机器故障势必导致经常的误工，使时间成本增加。高故障率还增加了维修成本和服务成本。故障引起的损坏零件或纸张的更换等也增加了新的开销，增加了整体打印成本以及产品的升级换代成本。最后，低打印质量的输出效果会对公司的整体形象产生负面影响，往往会造成无形资产的损失。
打印页数会偏少
所谓灌粉，实际上就是对打印机硒鼓进行改造，为已经用完炭粉的粉盒加粉。从理论上来说，任何打印机的粉盒都是可以加粉的，但是因为应用和实际操作的原因，并不是每个硒鼓和粉盒都可以加粉。由于加粉对鼓芯的磨损严重，打印张数也和原装的一样，因此，加粉颜色比原来的浅，对于打印质量有较高要求的用户并不适用。并且，即便是对打印质量没什么要求的，通常情况一支硒鼓的加粉次数为三次，之后如果继续使用，即需要更换硒鼓的配件，以维持优质的打印效果。
由此可见，灌粉并不是所谓的“低价超值”的省钱良方。少花钱，就必须要牺牲打印质量。光不说漏粉的概率有多高，其打印出来的文档在最初根本无法使用，更可怕的是灌粉这种方式带来的健康问题。
以硒鼓来说，通常灌粉的碳粉吸附能力都比较差，会有许多被浪费，直接打到废粉仓去。而废粉仓的设计容量是根据原装硒鼓的碳粉使用率计算而来。因此，当过多的非原装碳粉被清扫到废粉仓时，就会出现爆仓和漏粉现象。因为今天的非原装碳粉工艺简单，无法和原装硒鼓及打印机的原初设计相匹配，因此漏粉现象在所难免。
除了输出页数的减少，漏粉还会造成其他危害
漏粉的直接危害是机器故障率大增，打印效果下降，打印机寿命缩短。碳粉颗粒为悬浮物，会漂浮到空气中。人体吸入后，会对健康产生影响。尤其，非原装碳粉在生产过程中没有强制实施的环保标准，导致产品良莠不齐。
除去应用上的问题，用户或服务商自行灌粉时，通常将残余碳粉直接排放到自然环境中，从而对环境造成严重破坏。资料显示，每克碳粉即污染0.8立方米土地。据报道，被碳粉侵蚀的树木会加速死亡。而这些炭粉直接被排放到水中，足以令水质被严重的污染，不仅不能饮用，严重情况下还会导致水中生物全部死亡。
