1、这三者直接、最显而易见的区别，就是学费的区别。翻开招生计划本，一般情况下（特殊院校、专业除外）：
公办本科院校学费在4000-6000元/年之间；
民办本科院校学费在16000-20000元/年之间；
独立学院学费在16000-18000元/年之间。
2、办学主体
独立学院的举办方是普通高校与社会合作办学， 因此独立学院一般是设在某个大学的名下。
民办院校则有自己的校名，自己组织机构，自己的师资，自己的校园，自己独立颁发毕业证书。
3、办学层次
独立学院是指实施本科以上学历教育的普通高等学校与国家机构以外的社会组织或者个人合伙创立，因此独立学院一定是本科，而民办高校中专本科都有。
4、学历证书
独立学院和民办院校的的毕业生都可以获得获国家承认的学历证书，毕业证书可以在中国高等教育学生信息网上查询。
但独立学院毕业证书上加盖的是某某大学某某学院印章，而学校本部学生的毕业证书只盖有学校校名印章。例如厦门大学嘉庚学院的毕业证书加印的是“厦门大学嘉庚学院”的印章，区别于本部的“厦门大学”印章。
民办院校的毕业证加印的就是学校校名的印章。
扩展资料：
公办大学即公立大学。公立大学是国家组建的大学，国家提供部分资金建设。中国的公立大学比私立要好，因为公立大学组建历史悠久，文化底蕴浓厚，有较好的学风，学校策略相对稳定，民办院校其经费来源是由学院的举办方通过各种方式筹集得到，在经费、学费和其他一些相关的管理上也都是按照民办大学的方式进行管理；公办院校其经费全部来自国家拨款。
民办学校有三个明显特征：1.举办人不是国家机构；2.资金来源于非国家财政性经费；3.面向社会举办学校，也就是面向社会招收学生和学员，服务于不特定的群体和公民个人，而不是只招收某个团体、企业、行业、系统和特定群体的人为学生或学员。
独立学院是民办高等教育的重要组成部分，属于公益性事业，依法享有民办教育促进法、民办教育促进法实施条例规定的各项奖励与扶持政策；由省、自治区、直辖市人民政府教育行政部门主管本行政区域内的独立学院工作。截至2017年12月25日，全国共有独立学院260所。
参考资料：公立大学-百度百科
参考资料：民办学校-百度百科
参考资料：独立学院-百度百科
