民办本科是指国家机构以外的社会组织或者个人，利用非国家财政性经费，面向社会依法举办的本科高校或其他教育机构其办学层次是本科。民办本科，包括转设的独立学院、部分中外合作高校的本科专业、民办普通本科高校。民办本科包含2种类型：民办二本、民办三本。
独立学院是由普通本科高校（申请者）与社会力量（合作者，包括企业、事业单位，社会团体或个人和其他有合作能力的机构）合作举办的进行本科层次教育的高等教育机构。国家规定，申请者要对独立学院的教学和管理负责，并保证办学质量；合作者要负责提供独立学院办学所需的各项条件和设施，参与学院的管理、监督和领导。独立学院应具有独立法人资格，独立的校园校舍，独立进行教学和财产管理、招生和颁发毕业证书。由于独立学院属于本科层次，所以由教育部负责审批。凡未经教育部审批的，国家均不承认其学历。教育部审批的独立学院名单都在教育部网站上予以公布，可以到教育部网页http://www.moe.gov.cn/edoas/website18/67/info7067.htm去查询。
区别一
独立学院的举办方一定是普通高校，合作方是社会力量；而民办则只有社会力量作为举办者。因此，独立学院一般设在某个大学名下。比如山西大学商务学院，海南大学三亚学院等，这些学院，可能和挂名的大学同在一个校园，也可能有师资等方面的共享和交流，而民办学院没有这方面的优势。
区别二
独立学院是指实施本科以上学历教育的普通高等学校与国家机构以外的社会组织或者个人合伙创立，因此一定是本科，而民办高校专本科都有。
区别三
独立学院的毕业生将获得获国家承认的学历证书。与学校本部毕业证书不同的是，其毕业证书上加盖的是某某大学某某学院印章，而学校本部学生的毕业证书只盖有学校校名印章。独立学院与大学内部学院的重要区别都还在于其独立性。独立学院有独立的校园和基本办学设施，实施相对独立的教学组织和管理，独立进行招生，独立颁发学历证书，独立进行财务核算，应具有独立法人资格，能独立承担民事责任。而对民办院校则有自己的校名，自己组织机构，自己的师资，自己的校园，自己独立颁发毕业证书。
区别四
独立学院的专业是从当时母校中相对较热、较强的专业中建立设置的。独立学院母校名气大的生源会好一些，当然录取分数就会高一些。而民办院校的特色专业生源也会好一些，录取分数也会高一些。
